R-loop 测序分析优势 实验流程 结果展示 R-loop是由转录的RNA链与打开的双链DNA其中一条模板链发生碱基互补配对,形成RNA-DNA杂合链,同时使未配对的另一条DNA链游离在外组成的三方结构 。它们分布广泛,占哺乳动物基因组的 5% 。R-loop经常出现在基因组的启动子和转录终止位点, 影响R-loop形成的结构因素包括高度...
云序生物推出高灵敏R-Loop测序服务,DRIPc-Seq &ssDRIP-Seq基于S9.6抗体免疫沉淀,实现全基因组范围内进行R-Loop结构的DNA 或 RNA的检测,并具有高分辨、高灵敏、高特异性的特点。适用于肿瘤、免疫、神经和发育、植物生长和代谢等生命科学和精准医学领域的研究。 DRIPc-Seq测序技术 DRIPc技术简介: DRIPc-Seq(DNA:...
云序生物推出高灵敏R-Loop测序服务,DRIPc-Seq&ssDRIP-Seq基于S9.6抗体免疫沉淀,实现全基因组范围内进行R-Loop结构的DNA 或 RNA的检测,并具有高分辨、高灵敏、高特异性的特点。适用于肿瘤、免疫、神经和发育、植物生长和代谢等生命科学和精准医学领域的研究。 DRIPc-Seq测序技术 DRIPc技术简介: DRIPc-Seq(DNA:RN...
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)徐炜课题组联合清华大学孙前文课题组与孟安明课题组开发了一项高精度、超微量R-loop定量测序技术ULI-ssDRIP-seq,并基于该项技术揭示了R-loop在斑马鱼...
目前MapR的方法是利用双链DNA建库测序,不能明确的区分DNA:RNA杂合双链中的DNA是正链或负链,在以后的研究中将会通过单链DNA或者RNA建库解决链特异性问题。 原文链接: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.09.052 参考文献 1. Thomas, M., White, R. L.& Davis, R. W. Hybridization of RNA to doub...
诺禾致源表观组产品线拥有丰富的表观和转录调控类测序分析经验,支持全世界科研工作者发表高分文章500+篇,影响因子累计5000+,涉及的组学包括但不限于ATAC-seq、CUT&Tag、Ribo-seq、EM-seq、外泌体RNA测序、Hi-C、RNA甲基化(MeRIP-seq)、RNA IP-seq(RIP-seq)、芯片检测类和脱靶检测类等。
通过将多个标记后的样本混合在一管中,进行同步的R-loop富集及文库构建操作,mDRIP-seq技术实现了R-loop测序的高通量化和低成本化。和原有技术相比,mDRIP-seq每个样本的文库构建时间降低至1/6(图1c),平均文库构建成本降低至1/7(图1d...
DRIP-seq(DNA:RNA hybrid immunoprecipitation and sequencing)利用特异性识别DNA:RNA杂合链的S9.6抗体对包含R-loop结构的 DNA 链进行富集,后续通过DNA测序来实现 R-loop分析,侧重于通过NGS在基因组水平上检测R-loops结构的分布,并通过生物信息学分析在不同的领域从中挖掘出更多有用的信息。 DRIP-seq优势 严格的质...
本研究利用来自肺腺癌(LUAD)的单细胞RNA测序(RNA-seq)数据集,建立了一个R-loop评分模型,通过基于与EGFR突变、组织起源和TNM分期相关的已鉴定的R-loop调节因子来表征R-loop状态。研究的研究发现,R-loop评分可以反映肿瘤微环境特征,并预测抗肿瘤治疗效果。低R环评分与不良结局、抗癌治疗(如靶向治疗和化疗)的耐药性...
R-Loop是DNA-RNA双链和被置换的DNA单链组成的特殊三链核酸结构，首次于1976年被Thomas等通过电子显微镜观察发现。R-Loop在基因组中广泛存在，主要集中于转录起始和终止区域，参与基因表达调控、DNA复制及组蛋白修饰等生物学过程。为了深入研究R-Loop，云序生物推出了高灵敏度的R-Loop测序服务，包括DRIPc-...