GGPlot2(通常缩写为ggplot2)是一个在R语言中广泛使用的绘图包,以其灵活和强大的数据可视化功能而闻名。它基于"The Grammar of Graphics"一书的概念,允许用户通过组合不同的视觉元素来创建自定义的图形。而ggpubr是ggplot2的一个扩展包,它进一步简化了图形的创建过程,特别是对于初学者来说,提供了一种更为直观和易...
棒棒糖图有些类似我们传统的柱状图,由一根线条和一个圆形组成,比传统柱状图能表达更多信息。特别是在分类数目比较多的时候,如基因表达等,棒棒糖图更能很好的展示数据。今天我们使用R语言ggpubr包来绘制棒棒糖图,ggpubr包为ggplot的增强包,据说这是个为SCI而生的包,可以绘制出许多非常专业的SCI绘图,而已自带了很多期刊...
这里ggpubr包将ggplot2中的很多函数改编成了ggbarplot中的一个参数,相对来说,绘制时会简化一些代码,那么我们一起看看吧。 一、数据模拟 我们还是使用上次的数据,数据如下: mydata<-data.frame( category=c( rep( c("甲","乙","丙"),200), rep(c("乙","丙"),300) ),#这里构造发病传染病甲类传染病...
今天我们要分享的R包是 ggpubr 包,它是一款基于ggplot2的可视化包,功能非常强大,能够一行命令绘制出符合出版物要求的图形。ggpubr 包可绘制的图形类型非常多,有密度图、直方图、柱状图、饼图、棒棒糖图、Cleveland 点图、箱线图、小提琴图、点带图、点图、散点图、线...
采用R语言ggpubr包绘制分组箱线图,展示分类变量与连续变量的关系,叠加假设检验显著性结果代码发布在公众号:模型机器名为《R语言数据可视化系列5-ggpubr包实现均值水平比较检验与显著性标记图示》, 视频播放量 261、弹幕量 0、点赞数 8、投硬币枚数 2、收藏人数 5、转发人
【R语言】R package -- ggpubr ggpubr ggpubr专门为学术期刊绘图而生,据说是能画出editor最喜欢看的图。 1.安装和加载 由于这个包放在cran上,所以安装也方便,直接install.packages(). install.packages("ggpubr") library("ggpubr") 2.绘图示例
程辑包‘ggpubr’是用R版本4.0.5 来建造的 car包不存在就安装吧,安装还安装不了,依赖包quantreg,用普通的命令 install.packages("quantreg") 安装一次又一次的失败。 最后查到一种解决方法,quantreg的新版本安装不上,可以安装老版本 packageurl<-"https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/quantreg/quan...
R中ggpubr包中stat_compare_means函数method的默认值是什么 r软件numeric函数,1.数据管理numeric:数值型向量logical:逻辑型向量character;字符型向量list:列表data.frame:数据框c:连接为向量或列表√length:求长度subset:求子集 √seq,from:to,sequen
R绘图 ggpubr: 为学术而生（2）公众号：生信小课堂 偏差图 偏差图显示量化值到参考值的偏差。计算mpg数据的z值 # Calculate the z-score of the mpg datadfm$mpg_z <- (dfm$mpg -mean(dfm$mpg))/sd(dfm$mpg)dfm$mpg_grp <- factor(ifelse(dfm$mpg_z < 0, "low", "high"), levels = c...
使用R语言中的ggpubr包，我们可以轻松地创建优雅的小提琴图（violin plots）。以下是绘制这些图表的步骤和技巧。1. 创建基本小提琴图：- 使用`ggviolin()`函数，我们可以快速生成包含两个分组的小提琴图。- 通过修改参数，我们可以改变颜色方案，并且可以选择不同的杂志风格，例如"npg"或"aaas"。2. ...