热爱数据科学与开源工具(R),致力于利用数据科学迅速积累行业经验优势和科学知识发现,著有《R语言高效数据处理指南》、… HopeR发表于R语言数据... ggpubr——绘制SCI发表级的各种散点图 练习题 R语言学习笔记之一:选取子集 Eric Yu R语言入门4:数据框元素的提取和作图 曹务强发表于菜鸟学飞记...
这里ggpubr包将ggplot2中的很多函数改编成了ggbarplot中的一个参数,相对来说,绘制时会简化一些代码,那么我们一起看看吧。 一、数据模拟 我们还是使用上次的数据,数据如下: mydata<-data.frame( category=c( rep( c("甲","乙","丙"),200), rep(c("乙","丙"),300) ),#这里构造发病传染病甲类传染病...
文章被收录于专栏:R语言交流中心 在整理图像的时候会让人觉得苦恼的就是怎么让绘图风格统一、画风高级。今天就跟大家介绍一个画图的神器,据说可以直接赢得主编的好感。此包就是ggpubr,一个联合ggplot2包进行绘图工具包。首先看下包的安装: 代码语言:javascript 复制 install.packages("ggpubr") 接下来我们通过实例...
今天我们要分享的R包是 ggpubr 包,它是一款基于ggplot2的可视化包,功能非常强大,能够一行命令绘制出符合出版物要求的图形。ggpubr 包可绘制的图形类型非常多,有密度图、直方图、柱状图、饼图、棒棒糖图、Cleveland 点图、箱线图、小提琴图、点带图、点图、散点图、线...
r语言ggpubr r语言ggpubr是什么意思 棒棒糖图有些类似我们传统的柱状图,由一根线条和一个圆形组成,比传统柱状图能表达更多信息。特别是在分类数目比较多的时候,如基因表达等,棒棒糖图更能很好的展示数据。今天我们使用R语言ggpubr包来绘制棒棒糖图,ggpubr包为ggplot的增强包,据说这是个为SCI而生的包,可以绘制出...
采用R语言ggpubr包绘制分组箱线图,展示分类变量与连续变量的关系,叠加假设检验显著性结果代码发布在公众号:模型机器名为《R语言数据可视化系列5-ggpubr包实现均值水平比较检验与显著性标记图示》, 视频播放量 261、弹幕量 0、点赞数 8、投硬币枚数 2、收藏人数 5、转发人
ggpubr ggpubr专门为学术期刊绘图而生,据说是能画出editor最喜欢看的图。 1.安装和加载 由于这个包放在cran上,所以安装也方便,直接install.packages(). install.packages("ggpubr")library("ggpubr") 2.绘图示例 Gene expression data Box plots
今天我们要进入ggpubr 包最后一期的学习啦。细细想一下,经过前两期的展示,我们在课堂上比较熟悉的绘图类型基本上都学习到了呢。今天呢,我们给大家带来的绘图内容相对来说没有那么“眼熟”,但是有的时候也能派上用场呢,它们分别是:误差棒图、经验累积密度分布图、qq ...
R绘图：配对样本差异表达作图ggpubr 公众号：生信小课堂 现实中有很多数据都是配对的，最常见的就是癌和癌旁，ggpubr包的ggpaired函数可以实现配对样本的统计和作图 加载数据 rm(list = ls())library(tidyverse)library(ggpubr)pairdata<-read.table('pair.txt',header = T,sep = '\t')ggpaired用法 ggpaire...
rstatix包支持管道符,与tidyverse包设计理念相一致,用于执行基本的统计检验,包括t检验、Wilcoxon检验、ANOVA、Kruskal-Wallis和相关性分析。 ggpubr包提供了一些易于使用的函数,基于ggplot2,可绘制用于文章发表的各种图形。当然,ggpubr也提供了一些统计函数,但是rstatix在统计方面更加丰富。