R语言|ggpubr 包绘图系列(1) 今天我们要分享的R包是 ggpubr 包,它是一款基于ggplot2的可视化包,功能非常强大,能够一行命令绘制出符合出版物要求的图形。ggpubr 包可绘制的图形类型非常多,有密度图、直方图、柱状图、饼图、棒棒糖图、Cleveland 点图、箱线图、小提琴...
GGPlot2(通常缩写为ggplot2)是一个在R语言中广泛使用的绘图包,以其灵活和强大的数据可视化功能而闻名。它基于"The Grammar of Graphics"一书的概念,允许用户通过组合不同的视觉元素来创建自定义的图形。而ggpubr是ggplot2的一个扩展包,它进一步简化了图形的创建过程,
安装方式有两种: 直接从CRAN安装: install.packages("ggpubr") 从GitHub上安装最新版本: if(!require(devtools)) install.packages("devtools") devtools::install_github("kassambara/ggpubr") 安装完之后直接加载就行: library(ggpubr) ggpubr可绘制图形 ggpubr可绘制大部分我们常用的图形,下面一一介绍。 分...
【R语言】R package -- ggpubr ggpubr ggpubr专门为学术期刊绘图而生,据说是能画出editor最喜欢看的图。 1.安装和加载 由于这个包放在cran上,所以安装也方便,直接install.packages(). install.packages("ggpubr") library("ggpubr") 2.绘图示例 Gene expression data Box plots Violin plots Stripcharts a...
热爱数据科学与开源工具(R),致力于利用数据科学迅速积累行业经验优势和科学知识发现,著有《R语言高效数据处理指南》、… HopeR发表于R语言数据... ggpubr——绘制SCI发表级的各种散点图 练习题 R语言学习笔记之一:选取子集 Eric Yu R语言入门4:数据框元素的提取和作图 曹务强发表于菜鸟学飞记...
从GitHub上安装最新版本: if(!require(devtools))install.packages("devtools")devtools::install_github("kassambara/ggpubr") 安装完之后直接加载就行: library(ggpubr) ggpubr可绘制图形: ggpubr可绘制大部分我们常用的图形,下面一一介绍。 分布图(Distribution) ...
Hadley Wickham创建的可视化包ggplot2可以流畅地进行优美的可视化,但是如果要通过ggplot2定制一套图形,尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形,对于那些没有深入了解ggplot2的人来说就有点困难了,ggplot2的部分语法是很晦涩的。为此Alboukadel Kassambara创建了基于ggplot2的可视化包ggpubr用于绘制符合出版物要求的图形。
在整理图像的时候会让人觉得苦恼的就是怎么让绘图风格统一、画风高级。今天就跟大家介绍一个画图的神器,据说可以直接赢得主编的好感。此包就是ggpubr,一个联合ggplot2包进行绘图工具包。首先看下包的安装:
R绘图 ggpubr: 为学术而生（1）公众号：生信小课堂 安装包 install.packages("ggpubr")密度图 带平均线和边缘地毯的密度图 library(ggpubr)#> Loading required package: ggplot2#> Loading required package: magrittr# Create some data format# :::set.seed(1234)wdata = data.frame( sex = facto...
每次在安装bioconductor的R包之前,都要先运行以下代码更换镜像,任选一个运行即可,目前我推荐你使用西湖大学的镜像,原因请看bioconductor有新的镜像选择啦: # 使用清华大学的镜像 options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")