PROTAC-DB 3.0的更新内容概览 [访问链接:http://cadd.zju.edu.cn/protacdb/] 与在前两个版本(PROTAC-DB 1.0和2.0)中收集数据的方法一致,作者团队使用关键词‘degrader* OR proteolysis targeting chimera’在PubMed数据库中搜索原始论文,对于每篇文章,手动收...
关于成药性参数,PROTAC的细胞渗透性数据从41项增加到64项。详细更新情况如表1所示。 表1. PROTAC-DB 3.0与之前版本的数据统计对比 此外,本次更新增加了药物代谢动力学参数信息,共计145项。药物代谢动力学参数信息显示在PROTAC详细信息页面的单独选项卡中,如图1所示。 图1. PROTAC详细信息页中的药物代谢动力学...
目前,PROTAC-DB已经囊括了1662个PROTAC、202个弹头(靶向目标蛋白质的小分子)、65个E3配体(能够招募E3连接酶的小分子)和806个Linker以及它们的化学结构、生物活性和理化性质。其中,PROTAC-DB详细提供了弹头和E3配体的生物活性以及PROTAC的降解能力、结合亲和力和细胞活性。PROTAC-DB可以通过两种常用的搜索方法进行查询:...
为了促进PROTAC的合理设计,文章提出PROTAC-DB,这是一个基于Web的开放访问数据库,它集成了PROTAC的结构信息和实验数据。 目前,PROTAC-DB包括1662个PROTAC,202个弹头(靶向目标蛋白质的小分子),65个E3配体(能够募集E3连接酶的小分子)和806个接头,以及它们的化学结构,生物学活性和理化性质。除了弹头和E3配体的生物活...
PROTAC-DB 3.0:最新版本的PROTAC数据库 近年,人工智能辅助药物设计(AIDD)加速了包括PROTAC降解剂在内的药物开发,而药物分子数据库在AIDD中发挥着关键作用。 2024年9月初,来自浙江大学的Jingxuan Ge等人在 Nucleic Acids Research 上展示了在线数据库PROTAC-DB 3.0的更新内容。 PROTAC-DB 1.0 2.0 3.0的数据统计;...
近日，浙江大学药学院侯廷军教授课题组在 Nucleic Acids Research 期刊发表了题为：PROTAC-DB 2.0: an updated database of PROTACs 的论文，对初代PROTAC-DB做出了重大更新。PROTAC-DB始建于2020年，是首个PROTAC在线数据平台，囊括了化学结构、生物活性、理化性质在内的多种数据，现已成为PROTAC领域的重要数据...
蛋白降解靶向嵌合体(Proteolytic targeting chimera,PROTAC)是一种新兴的药物治疗手段,其可介导靶蛋白和E3泛素连接酶间的相互作用,并通过泛素-蛋白酶体系统实现对靶蛋白的特异性降解。凭借着不同于传统小分子抑制剂的作用机制,PROTAC有望靶向...
靶向蛋白降解嵌合体(PROTAC)是一种双功能分子,由结合靶蛋白(POI)配体、E3连接酶结合配体和连接它们的Linker三部分组成,可利用体内天然存在的泛素-蛋白酶体系统(UPS)降解致病蛋白从而达到治疗疾病的目的。该技术已经成为一种全新的药物开发手段,并得到科研院所、药企和投资机构的青睐。截至目前,有19款PROTAC药物处于临...
dBRD9 是一种 PROTAC,能选择性的降解 BRD9。dBRD9 改进了溴域接合剖面,降低了整个 BET 家族的结合活性。相关厂家报价 产品名称价格公司名称报价日期 化合物dBRD9|T31221|TargetMol ￥987 VIP3年 TargetMol中国(陶术生物) 2025-02-28 dBRD9 询价 北京百奥创新科技有限公司 ...
图1显示了PROTAC-DB的基本数据收集与处理阶段。应用计算机检索PubMed数据库中的PROTAC信息,检索词为“degrader* OR protac OR proteolysis targeting chimera”。收集有关小分子PROTACs的文献,排除多肽基PROTACs和HaloTag PROTACs的文献。随后,从文献中手工提取了PROTACs的化学结构和生物活性,生物活性包括降解能力、结合亲...