PROTAC-DB 3.0的更新内容概览 [访问链接:http://cadd.zju.edu.cn/protacdb/] 与在前两个版本(PROTAC-DB 1.0和2.0)中收集数据的方法一致,作者团队使用关键词‘degrader* OR proteolysis targeting chimera’在PubMed数据库中搜索原始论文,对于每篇文章,手动收...
关于成药性参数,PROTAC的细胞渗透性数据从41项增加到64项。详细更新情况如表1所示。 表1. PROTAC-DB 3.0与之前版本的数据统计对比 此外,本次更新增加了药物代谢动力学参数信息,共计145项。药物代谢动力学参数信息显示在PROTAC详细信息页面的单独选项卡中,如图1所示。 图1. PROTAC详细信息页中的药物代谢动力学...
目前,PROTAC-DB已经囊括了1662个PROTAC、202个弹头(靶向目标蛋白质的小分子)、65个E3配体(能够招募E3连接酶的小分子)和806个Linker以及它们的化学结构、生物活性和理化性质。其中,PROTAC-DB详细提供了弹头和E3配体的生物活性以及PROTAC的降解能力、结合亲和力和细胞活性。PROTAC-DB可以通过两种常用的搜索方法进行查询:...
近日，浙江大学药学院侯廷军教授课题组在 Nucleic Acids Research 期刊发表了题为：PROTAC-DB 2.0: an updated database of PROTACs 的论文，对初代PROTAC-DB做出了重大更新。PROTAC-DB始建于2020年，是首个PROTAC在线数据平台，囊括了化学结构、生物活性、理化性质在内的多种数据，现已成为PROTAC领域的重要数据...
在检索工具上,PROTAC-DB可以进行基于文本的检索和基于结构的检索。基于文本的搜索是在整个PROTAC-DB中进行搜索的一种简单方式,只需输入单个术语,如目标名称、化合物名称或ID。对于基于结构的搜索,用户可以在ChemDoodle编辑器中输入SMILES字符串、上传MOL/SDF文件或绘制分子草图。导入自编辑的分子后,可以从三个搜索选项...
The number of target-PROTAC-E3 ternary complex structures has also increased to 959. Recognizing the importance of druggability in PROTAC design, we have incorporated pharmacokinetic data to PROTAC-DB 3.0. To enhance user experience, we have added features for sorting based on molecular similarity...
尽管光响应型Pro-PROTAC分子通过光控条件改善了PROTAC脱靶毒性,但是由于光组织穿透性不佳与潜在光毒性的问题,这类型分子真正被应用于临床治疗中仍任重而道远。 02 酶催化响应型Pro-PROTAC 研究人员关注肿瘤微环境与正常细胞环境的差异性,将肿瘤细胞特征的内源性...
dBRD9 是一种 PROTAC,能选择性的降解 BRD9。dBRD9 改进了溴域接合剖面,降低了整个 BET 家族的结合活性。相关厂家报价 产品名称价格公司名称报价日期 化合物dBRD9|T31221|TargetMol ￥987 VIP3年 TargetMol中国(陶术生物) 2025-02-28 dBRD9 询价 北京百奥创新科技有限公司 ...
靶向蛋白降解嵌合体(PROTAC)是一种双功能分子,由结合靶蛋白(POI)配体、E3连接酶结合配体和连接它们的Linker三部分组成,可利用体内天然存在的泛素-蛋白酶体系统(UPS)降解致病蛋白从而达到治疗疾病的目的。该技术已经成为一种全新的药物开发手段,并得到科研院所、药企和投资机构的青睐。截至目前,有19款PROTAC药物处于临...
PROTAC分子由靶蛋白配体(POI ligand)、连接链(Linker)和E3连接酶配体(E3 ligand)三部分组成,是一种能特异性结合靶蛋白的同时招募E3连接酶的双功能分子。 PROTAC诱导蛋白降解的作用机制如下图所示:PROTAC在进入细胞后,其结构中的靶蛋白配体(POI ligand)特异性地与靶蛋白(POI)结合,另一端的E3连接酶配体(E3 ligan...