蛋白-蛋白相互作用 (protein-protein interaction, PPI) 是生物体调控各类生命活动的重要基础,在信号传导、细胞增殖、细胞死亡等病理生理过程中发挥重要作用。据统计,在人类中有大约有 65 万种 PPI,这些 PPI 在细胞中形成一个复杂的网络 (又被称为相互作用组),以调控各类蛋白质的生物活性。图 1. 蛋白质-蛋白...
解释说明 蛋白质互作网络(PPI, Protein-Protein Interaction Networks)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系,对了解生物系统中蛋白质的工作原理,了解疾病...
蛋白质互作网络(PPI, Protein-Protein Interaction Networks)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系,对了解生物系统中蛋白质的工作原理,了解疾病等特殊生理状态下生物信号和能量物质代谢的反应...
蛋白互作网络(PPI, Protein-Protein Interaction Networks)可以查看基因之间的联系,进而锁定关键基因。一般使用STRING数据库获取蛋白互作信息。STRING数据库:STRING: functional protein association networks (string-db.org)数据准备 要分析蛋白的名称列表,例如:使用STRING数据库获取PPI结果 选择Multiple proteins,将蛋白...
蛋白质互作网络(Protein-Protein Interaction Networks,PPI)是由蛋白通过彼此之间的相互作用构成,来参与生物信号传递、基因表达调节、能量和物质代谢及细胞周期调控等生命过程的各个环节。系统分析大量蛋白在生物系统中的相互作用关系,对了解生物系统中蛋白质的工作原理,了解疾病等特殊生理状态下生物信号和能量物质代谢的反应...
蛋白-蛋白相互作用 (protein-protein interaction, PPI) 是生物体调控各类生命活动的重要基础,在信号传导、细胞增殖、细胞死亡等病理生理过程中发挥重要作用。据统计,在人类中有大约有 65 万种 PPI,这些PPI 在细胞中形成一个复杂的网络(又被称为相互作用组),以调控各类蛋白质的生物活性。
蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合体(protein complex)的过程。在进行数据挖掘的时候往往会得到很多的差异表达的基因,当你对着一堆基因毫无头绪时,此时PPI数据库对你的数据挖掘起了很大的助攻作用。
PPI,全称为"Protein-Protein Interaction",直译为"蛋白质-蛋白质相互作用"。这个英文缩写词在生物学领域中广泛应用,尤其在研究生物网络和通路时具有重要价值。它的中文拼音为"dan bai zhi dan bai zhi xiang hù zuo yòng",在英语中的流行度达到了2236,属于Medical领域,特别是British Medicine中的...
PPI就是protein-protein interaction,即蛋白质与蛋白质的相互作用,顾名思义,PPI网络中的每个结点代表一种蛋白质,两个点之间的一条边代表他们之间的有相互作用的关系,多个蛋白同时进行互作关系分析产生的结果就是蛋白互作网络。 B:为什么我们要绘制PPI互作网络?
https://www.bioinformatics.com.cn/basic_protein_protein_interaction_network_by_igraph_256 2,示例数据 点击图片上方的示例数据,下载,并使用excel打开。 示例数据包括2列: 第1列是来源(source)节点的名字 第2列是靶(target)节点的名字 第3列是相互作用的score,来自stringdb数据库输出结果的最后一列。