display_numbers = TRUE, #是否显示每个色块对应的数值(经归一化后的数值) number_format = "%.2f", #数值格式,%.2f表示保留小数点后两位, #%.1e表示使用科学计数法并保留小数点后一位 number_color = "black", #设置数值颜色 fontsize_number = 6 #设置数值的字体大小 ) pdf("热图3.pdf",width = ...
pheatmap(data[, c(3:8)], cluster_rows = TRUE, cluster_cols = FALSE, cutree_rows = 3, annotation_col = annotation_col, annotation_row = annotation_row, border_color = NA, display_numbers = T) 第十二步:设置字体大小 pheatmap(data[, c(3:8)], cluster_rows = TRUE, cluster_cols = F...
display_numbers=TRUE:使用默认矩阵数据 pheatmap(data_norm,display_numbers=TRUE,cellheight=15,cellwidth=20,color=colorRampPalette(colors=c("purple","white","green"))(10)) 4. 在cell中添加mark display_numbers=matrix:使用自定义矩阵数据 fontsize_number=18:mark大小 filename="name.png/pdf": 保存 ...
Pheatmap是一个用于绘制热图的R语言包。它可以根据输入的数据生成具有颜色编码的矩阵,用于可视化数据集中的模式和关联性。 display_numbers参数是Pheatmap中的一个可选参数,用...
# 设定cell 的大小 代码语言:javascript 复制 pheatmap(test,cellwidth=15,cellheight=12,fontsize=10) 设定text 热图中展示数值 # display_numbers = TRUE参数设定在每个热图格子中显示相应的数值,#number_color参数设置数值字体的颜色 代码语言:javascript ...
fontsize_number:小格子中数字大小 display_numbers:逻辑值,是否在小格子中显示数字 number_format:小格子中数字显示形式,但仅有在display_numbers=T时才能使用 na_col:设置小格子为缺失值时的颜色 cellwidth:表示每个小格子的宽度 cellheight:表示每个小格子的高度 ...
display_numbers=TRUE, cellheight=15, cellwidth=20, color=colorRampPalette(colors = c("purple", "white", "green"))(10) ) 图4 4. 在cell中添加mark display_numbers=matrix:使用自定义矩阵数据 fontsize_number=18:mark大小 filename="name.png/pdf":保存 ...
fontsize_number则为显示每个数据的大小; 利用number_format可以设置保留小数位数或者字符串格式(如%.2f),但仅有在display_numbers=T时才能使用,很鸡肋,因此不建议使用该参数,而我们一般是直接显示RPKM值,所以我们需要之前对数据集进行保留小数处理,不然数据显示会超出单元格,如: ...
display_numbers = TRUE:设定在每个热图格子中显示相应的数值, number_color:设置数值字体的颜色 cellwidth和cellheight:设定每个热图格子的宽度和高度 main:添加主标题 fontsize_row 和fontsize_row:设置行名列名文字大小 未 完 待 续 下课铃响 今天的教学就到这咯 ...