show_colnames = TRUE, fontsize = 8, display_numbers = TRUE, #是否显示每个色块对应的数值(经归一化后的数值) number_format = "%.2f", #数值格式,%.2f表示保留小数点后两位, #%.1e表示使用科学计数法并保留小数点后一位 number_color = "black", #设置数值颜色 fontsize_number = 6 #设置数值的...
fontsize_number 表示热图上显示数字的字体大小 angle_col 表示列标签的角度,可选择 “0”,“45”,“90”,“270”,“315” display_numbers 表示是否在单元格上显示原始数值或按照特殊条件进行区分标记 number_format 表示热图单元格上显示的数据格式,如“%.2f” 表示两位小数; “%.1e” 表示科学计数法number_...
main:设置图的标题 fontsize:是设置所有除主图以外的标签的大小 number_color:字体的颜色 show_rownames:是否显示行名 fontsize_row:行名的字体大小 labels_row:X轴坐标名设置 show_colnames:是否显示列名 fontsize_col:列名的字体大小 labels_col:y轴坐标名设置 我们修改了字体大小,不显示样本名,以及设置图片标题...
默认:fondsize fontsize_col同上 angle_col 列标签的角度,可以选择0,45,270,315 display_numbers 是否在单位元素(cell)内显示数字 默认:F number_format 显示在cell内的数字格式,例如%.2代表两位小数%.1e表示指数形式...参见C语言printf函数格式 默认:%.2f fontsize_number 限制在Cell内的数字大小 默认:0.8*f...
fontsize_number=18, filename="mark.pdf" ) 图5 5. 根据tree将热图分割成2行3列 cutree_rows=num:分割行 cutree_cols=num:分割列 pheatmap(data_norm, cellheight=20, cellwidth=25, color=colorRampPalette(colors = c("purple","white","green"))(10), display_numbers=data_mark, fontsize_number...
number_color = "black", #设置数值颜色 fontsize_number = 6 #设置数值的字体大小 ) pdf("热图3.pdf",width = 12,height = 8) p3 dev.off() 不仅如此,通过设置display_numbers为维度与绘制热图的数据data相同的矩阵,可以在色块上个性化显示各种信息。比如当某个基因在某个样本中表达量的fpkm值大于10的时...
fontsize_number则为显示每个数据的大小; 利用number_format可以设置保留小数位数或者字符串格式(如%.2f),但仅有在display_numbers=T时才能使用,很鸡肋,因此不建议使用该参数,而我们一般是直接显示RPKM值,所以我们需要之前对数据集进行保留小数处理,不然数据显示会超出单元格 ...
fontsize_number = 0.8 * fontsize, gaps_row = NULL, gaps_col = NULL, labels_row = NULL, labels_col = NULL, filename = NA, width = NA, height = NA, silent = FALSE, na_col = "#DDDDDD", ...) 1、数据准备 #用来画热图的数据 ...
number_format = "%.2f", number_color = "grey30", fontsize_number = 0.8 * fontsize, gaps_row = NULL, gaps_col = NULL, labels_row = NULL, labels_col = NULL, filename = NA, width = NA, height = NA, silent = FALSE, na_col = "#DDDDDD", ...) ...
pheatmap包的中文名字：pheatmap包：美观的热力图说明书 Package‘pheatmap’October14,2022 Type Package Title Pretty Heatmaps Version1.0.12 Date2018-12-26 Author Raivo Kolde Maintainer Raivo Kolde<***> Depends R(>=2.0)Description Implementation of heatmaps that offers more control over dimensions...