fontsize_number 表示热图上显示数字的字体大小 angle_col 表示列标签的角度,可选择 “0”,“45”,“90”,“270”,“315” display_numbers 表示是否在单元格上显示原始数值或按照特殊条件进行区分标记 number_format 表示热图单元格上显示的数据格式,如“%.2f” 表示两位小数; “%.1e” 表示科学计数法number_...
fontsize =10, fontsize_row = fontsize, fontsize_col = fontsize, angle_col = c("270","0","45","90","315"), display_numbers =F, number_format ="%.2f", number_color ="grey30", fontsize_number =0.8 * fontsize, gaps_row =NULL, gaps_col =NULL, labels_row =NULL, labels_co...
fontsize_number = 10 ) 或者,为display_numbers参数传递一个矩阵 例如,根据表达值是否大于100来显示不同的标记 pheatmap( df, scale = "row", display_numbers = matrix(ifelse(df > 100, "+", "-"), nrow = nrow(df)), number_color = "#4daf4a", fontsize_number = 10 ) 7. 分块 在不对...
默认:fondsize fontsize_col同上 angle_col 列标签的角度,可以选择0,45,270,315 display_numbers 是否在单位元素(cell)内显示数字 默认:F number_format 显示在cell内的数字格式,例如%.2代表两位小数%.1e表示指数形式...参见C语言printf函数格式 默认:%.2f fontsize_number 限制在Cell内的数字大小 默认:0.8*f...
fontsize_number=18, filename="mark.pdf" ) 图5 5. 根据tree将热图分割成2行3列 cutree_rows=num:分割行 cutree_cols=num:分割列 pheatmap(data_norm, cellheight=20, cellwidth=25, color=colorRampPalette(colors = c("purple","white","green"))(10), display_numbers=data_mark, fontsize_number...
fontsize_number=18:mark大小 filename="name.png/pdf":保存 data_mark=data_norm # 新建mark矩阵 for(i in 1:20){ for(j in 1:10){ if(data_norm[i,j] <= 0.001) { data_mark[i,j]="***" } elseif(data_norm[i,j] <= 0.01 && data_norm[i,j] > 0.001) ...
fontsize_number = 0.8 * fontsize, gaps_row = NULL, gaps_col = NULL, labels_row = NULL, labels_col = NULL, filename = NA, width = NA, height = NA, silent = FALSE, na_col = “#DDDDDD”, …) 第1步:数据准备 用来画热图的数据 ...
number_color = "black", #设置数值颜色 fontsize_number = 6 #设置数值的字体大小 ) pdf("热图3.pdf",width = 12,height = 8) p3 dev.off() 不仅如此,通过设置display_numbers为维度与绘制热图的数据data相同的矩阵,可以在色块上个性化显示各种信息。比如当某个基因在某个样本中表达量的fpkm值大于10的时...
number_format = "%.2f", number_color = "grey30", fontsize_number = 0.8 * fontsize, gaps_row = NULL, gaps_col = NULL, labels_row = NULL, labels_col = NULL, filename = NA, width = NA, height = NA, silent = FALSE, na_col = "#DDDDDD", ...) ...
fontsize_number则为显示每个数据的大小; 利用number_format可以设置保留小数位数或者字符串格式(如%.2f),但仅有在display_numbers=T时才能使用,很鸡肋,因此不建议使用该参数,而我们一般是直接显示RPKM值,所以我们需要之前对数据集进行保留小数处理,不然数据显示会超出单元格 ...