然后，您可以单独设置行和列标签大小(fontsize_row、fontsize_col)。这种方法的唯一问题是，您的注释标...
pheatmap(data[, c(3:8)], cluster_rows = TRUE, cluster_cols = FALSE, cutree_rows = 3, annotation_col =annotation_col, annotation_row = annotation_row, border_color = NA, display_numbers = T, fontsize = 11)也可使用fontsize_row和fontsize_col分别对行标签和列标签进行字体大小设置。pheatma...
pheatmap(test, cluster_row = FALSE,cluster_col = TRUE) # treeheight_row和treeheight_col参数设定行和列聚类树的高度,默认为50 pheatmap(test, treeheight_row = 30, treeheight_col = 50) # 设定cell 的大小 pheatmap(test, cellwidth = 15, cellheight = 12, fontsize = 10) 设定text 热图中展示...
- main:热图的标题。 - fontsize_row, fontsize_col:行和列标签的字体大小。 - fontsize:矩阵内数值的字体大小。 - breaks:颜色映射的断点。 - show_rownames, show_colnames:是否显示行或列的名称,默认为TRUE。 具体的用法可以通过查看pheatmap包的官方文档和函数帮助文档来了解更多细节。©...
fontsize_row:行名的字体大小 labels_row:X轴坐标名设置 show_colnames:是否显示列名 fontsize_col:列名的字体大小 labels_col:y轴坐标名设置 我们修改了字体大小,不显示样本名,以及设置图片标题,到此时,经过一系列参数更改,是不是已经比一开始使用默认参数好看多了呢?(可以增加一个对比图,GSE19804_tumor_vs_norma...
annotation_names_col同理 drop_levels 是否在图例显示unused levels 默认:TRUE shown_rownames 是否显示行名 默认:T shown_colnames 是否显示列名 默认:T main 图表主标题 默认:NA fondsize 图表字体大小 默认:10 fontsize_row 行标题的字号 默认:fondsize ...
fontsize = 8 #字体大小,可以通过fontsize_row、fontsize_col参数分别设置行列名的字体大小 ) pdf("热图1.pdf",width = 12,height = 8) p1 dev.off() 图2 有几个问题需要注意一下: ①参数设置归一化方向。为什么要进行归一化呢? 我们前面介绍过,热图是利用颜色变化来直观地展示数值的变化。但如果绘制热图...
然而,默认情况下,列字体是正常的,怎么才能让它们加粗呢?可以通过fontsize_col参数调整字体大小,并结合grid::textGrob函数来实现加粗效果。 加粗列字体 要加粗列的字体,可以借助pheatmap的gtable功能和grid包借助一些小技巧实现。以下是一个如何将列字体加粗的示例代码: ...
fontsize_row:行名的字体大小 labels_row:X轴坐标名设置 show_colnames:是否显示列名 fontsize_col:列名的字体大小 labels_col:y轴坐标名设置 我们修改了字体大小,不显示样本名,以及设置图片标题,到此时,经过一系列参数更改,是不是已经比一开始使用默认参数好看多了呢?(可以增加一个对比图,GSE19804_tumor_vs_norma...
fontsize_number = 0.8 * fontsize, gaps_row = NULL, gaps_col = NULL, labels_row = NULL, labels_col = NULL, filename = NA, width = NA, height = NA, silent = FALSE, na_col = "#DDDDDD", ...) 1、数据准备 #用来画热图的数据 ...