按照这个过程,我可以检索一些HMM,但是我必须在keyfile中指定名称。这种方法不方便,因为我必须检索原始文件中存在的所有HMM。 我尝试做的下一件事是使用以下命令将原始文件拆分为单个文件: csplit --digits=2 --quiet --prefix=hmm Pfam-A.hmm "///+1" "{*}" 将文件拆分为单独的文件非常有效,我唯一不知道的...
4、Pfam-A.full.uniprot.gz:针对UniProtKB进行搜索,得到的curated家族的完整比对结果。 5、Pfam-A.hmm.dat.gz:包含每个 Pfam-A 家族信息的数据文件 6、Pfam-A.hmm.gz:Pfam HMM 库,用于结构域比对 官方说明:https://pfam-docs.readthedocs.io/en/latest/ftp-site.html 三、Pfam-A本地化 ##下载Pfam-A.hmm...