在一项实验中,利用Perturb-Seq、CRISP-Seq或将这两种技术结合在一起研究众多基因扰动是可能的[3]。 Perturb-Seq和CRISP-Seq背后的工作原理是给单个基因扰动和受到影响的细胞添加条形码...阅读全文 平行标定两次的误差范围是多少 算误差要看你的滴定液的浓度,不过体积的误差一般要求不超过0.05ml,也就是1滴的样子。
Perturb-seq也叫CRISP-seq 和CROP-seq,主要指的是一种在pooled 基因干扰筛选基础上进行scRNA-seq的一种技术。简单理解就是multiplexed CRISPR inactivation和单细胞RNA-seq,在pool中每一个被干扰的基因引起的转录组变化都可以被检测到,从而用来评价每一个干扰上的基因表达原型变化。(个人理解在CRISPR pool的基础上进行...
在一项实验中,利用Perturb-Seq、CRISP-Seq或将这两种技术结合在一起研究众多基因扰动是可能的[3]。 Perturb-Seq和CRISP-Seq背后的工作原理是给单个基因扰动和受到影响的细胞添加条形码以至于利用测序能够鉴定出这两者。简单地说,靶向感兴趣基因的添加独特条形码的CRISPR向导RNA文库被导入一个细胞群体中。随后利用添加独特...
- Perturb-seq (also known as CRISP-seq and CROP-seq) refers to a high-throughput method of performing single cell RNA sequencing (scRNA-seq) on pooled genetic...- In mathematics and physics, a non-perturbative function or process is one that cannot be described by perturbation theory. An...
第一批应用:Perturb-seq: Dissecting molecular circuits with scalable single cell RNA profiling of pooled genetic screens - 2017 - Cell 第一代其他: Dissecting Immune Circuits by Linking CRISPR-Pooled Screens with Single-Cell RNA-Seq - Science - 2016 【CRISP-seq】 ...
Datlinger2017 (Crop-seq) 33 perturbations of regulators of TCR signalling and transcription factors in the T-cell receptor pathway in Jurkat cells (GSE92872). Jaitin2016 (Crisp-seq) 22 perturbations of immune related genes in mouse (GSE90486) ...
Perturb-Seq和CRISP-Seq背后的工作原理是给单个基因扰动和受到影响的细胞添加条形码以至于利用测序能够鉴定出这两者。简单地说,靶向感兴趣基因的添加独特条形码的CRISPR向导RNA文库被导入一个细胞群体中。随后利用添加独特条形码的引物将单个细胞的mRNA提取出。对这些mRNA进行测序揭示出CRISPR靶向基因和由此产生的单个细胞的转录...
Perturb-Seq和CRISP-Seq背后的工作原理是给单个基因扰动和受到影响的细胞添加条形码以至于利用测序能够鉴定出这两者。简单地说,靶向感兴趣基因的添加独特条形码的CRISPR向导RNA文库被导入一个细胞群体中。随后利用添加独特条形码的引物将单个细胞的mRNA提取出。对这些mRNA进行测序揭示出CRISPR靶向基因和由此产生的单个细胞的转录...