为了阐明衰老细胞中PD-L1表达增加的调控机制,研究团队对PD-L1阳性衰老细胞进行了RNA-seq分析。研究结果显示,PD-L1在衰老细胞中的异质积累至少部分是由于E2F1结合基序介导的转录和蛋白酶体活性降低引起的。此外,通过体外T细胞杀伤实验,研究人员发现,P...
通过RNA-seq 检测了衰老细胞和静止细胞之间转录特征存在差异表达(图2c)。通过GO和GSEA分析显示,衰老细胞中上调的基因主要集中在炎症、细胞因子产生、T 细胞活化、抗原呈递相关的基因中(图2d)。另外观察到在静止细胞中加入CD8+T细胞没有表现出差异毒性,...
为了阐明衰老细胞中PD-L1表达的调控机制,作者对PD-L1−和PD-L1+ d-Sen HCA2细胞进行了RNA-seq分析,发现只有E2F1结合基序在PD-L1的启动子区域富集,提示PD-L1+衰老细胞中可能残留较弱的E2F1活性并轻微诱导PD-L1转录。另一方面,作者发现在PD-L1+衰老细胞中,chymotrypsin-like蛋白酶活性、trypsin-like蛋白酶活性和...
相比之下,使用PD-L1测试预测应答的患者在总生存期方面没有显示出明显的差异。那些PD-L1联合阳性分数(CPS)为20或更高的患者,是更好的反应的潜在指标,他们的中位总生存期为222天,而那些PD-L1 CPS小于20的患者的中位生存期为289天。 OncoPrism检验利用RNA-seq模型描述了肿瘤组织样本中五种T细胞亚型的丰度。该试...
为了阐明衰老细胞中PD-L1表达增加的调控机制，研究团队对PD-L1阳性衰老细胞进行了RNA-seq分析。研究结果显示，PD-L1在衰老细胞中的异质积累至少部分是由于E2F1结合基序介导的转录和蛋白酶体活性降低引起的。此外，通过体外T细胞杀伤实验，研究人员发现，PD-L1阳性衰老细胞对T细胞免疫监视有抵抗力，表明衰老细胞中的PD-L1...
通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)对人类TAMs进行转录组学分析，发现其具有高度异质性，但缺乏PD-L1的表达。这可能是由于PD-L1基因从scRNA-seq数据中缺失，因为它是一种低丰度转录本。使用生物信息学模拟和scRNA-seq数据的研究表明，人类PD-L1+TAMs上调抗原呈递基因，可能对T细胞产生免疫抑制。另一方面，通过离体功能测定...
在机制研究方面,分析RNA-seq结果后发现,敲除DENR后肿瘤细胞PD-L1 mRNA水平显著降低,同时伴随IFNγ-JAK-STAT信号通路受损。对DENR敲除细胞JAK-STAT通路进行WB检测,发现JAK2的蛋白水平显著降低,而mRNA水平不受影响。进一步研究发现JAK2的5’UTR中存在3个上游阅读框(uORF)序列,通过荧光报告实验、Ribo-qPCR和Ribo-seq数据...
为了进一步明确我们在CGGA数据库中的发现,我们从TCGA网络中得到了神经胶质瘤的RNA seq数据,并且发现两个队列结果具有一致性。这是第一个对PD-L1在全分级胶质瘤中表达水平的分子和临床标征方面的综合研究。 方法 样本和数据收集 在CGGA数据库中,我们收集了301个转录数据样本,这些样本是由国家安捷伦全人类基因组芯片...
对经IFN-γ处理或不处理的小肠类器官进行RNA-seq分析,研究者们发现编码PD-L1蛋白的Cd274基因与MHC II关联基因的表达显著相关(图3A-B)。类器官实验(图3C)和体内实验(图3D-E)都表明IFN-γ能显著影响PD-L1表达量。为了进一步证实DP IELs分化需要IECs上PD-L1的表达,研究者们使用了PD-L1敲除小鼠(PD-L1−/...
目前，除了PD-L1，肿瘤突变负荷（TMB）、循环肿瘤 DNA（ctDNA）、基于RNA-Seq的免疫相关评分（例如：效应T细胞的CXCL9、CXCL10表达，IFNα、IFNγ）等，多项研究正在进行，期待这些研究能带来更确切的结论。有句话是这样说的，日久见人心，患难见真情。PD-L1抑制剂和UC之间的坎坷，反而能促使我们去更深入的探索...