相比之下,使用PD-L1测试预测应答的患者在总生存期方面没有显示出明显的差异。那些PD-L1联合阳性分数(CPS)为20或更高的患者,是更好的反应的潜在指标,他们的中位总生存期为222天,而那些PD-L1 CPS小于20的患者的中位生存期为289天。 OncoPrism检验利用RNA-seq模型描述了肿瘤组织样本中五种T细胞亚型的丰度。该试...
为了阐明衰老细胞中PD-L1表达增加的调控机制,研究团队对PD-L1阳性衰老细胞进行了RNA-seq分析。研究结果显示,PD-L1在衰老细胞中的异质积累至少部分是由于E2F1结合基序介导的转录和蛋白酶体活性降低引起的。此外,通过体外T细胞杀伤实验,研究人员发现,PD-L1阳性衰老细胞对T细胞免疫监视有抵抗力,表明衰老细胞中的PD-L1...
通过RNA-seq 检测了衰老细胞和静止细胞之间转录特征存在差异表达(图2c)。通过GO和GSEA分析显示,衰老细胞中上调的基因主要集中在炎症、细胞因子产生、T 细胞活化、抗原呈递相关的基因中(图2d)。另外观察到在静止细胞中加入CD8+T细胞没有表现出差异毒性,...
为了阐明衰老细胞中PD-L1表达增加的调控机制,研究团队对PD-L1阳性衰老细胞进行了RNA-seq分析。研究结果显示,PD-L1在衰老细胞中的异质积累至少部分是由于E2F1结合基序介导的转录和蛋白酶体活性降低引起的。此外,通过体外T细胞杀伤实验,研究人员发现,P...
数据显示,老年小鼠(24-26月龄)中的PD-L1+ tdTomato+细胞群体显著大于年轻小鼠(2月龄)。体内动力学结果也提示, PD-L1+衰老细胞随着年龄的增长而积累。为了阐明衰老细胞中PD-L1表达的调控机制,作者对PD-L1−和PD-L1+ d-Sen HCA2细胞进行了RNA-seq分析,发现只有E2F1结合基序在PD-L1的启动子区域富集,提示PD-...
为了阐明衰老细胞中PD-L1表达增加的调控机制,研究团队对PD-L1阳性衰老细胞进行了RNA-seq分析。研究结果显示,PD-L1在衰老细胞中的异质积累至少部分是由于E2F1结合基序介导的转录和蛋白酶体活性降低引起的。此外,通过体外T细胞杀伤实验,研究人员发现,PD-L1阳性衰老细胞对T细胞免疫监视有抵抗力,表明衰老细胞中的PD-L1表达...
为了进一步明确我们在CGGA数据库中的发现,我们从TCGA网络中得到了神经胶质瘤的RNA seq数据,并且发现两个队列结果具有一致性。这是第一个对PD-L1在全分级胶质瘤中表达水平的分子和临床标征方面的综合研究。 方法 样本和数据收集 在CGGA数据库中,我们收集了301个转录数据样本,这些样本是由国家安捷伦全人类基因组芯片...
细胞核内PD-L1的双重作用 RNA-seq和ChIP-seq分析表明,细胞核内的PD-L1可以与DNA结合,并作为基因转录的调节因子。 通过RNA-seq分析,研究人员发现在PD-L1敲除细胞中发现了PD-L1 ChIP-seq峰基因和差异表达基因之间存在较大的重叠。PD-L1敲除细胞中下调的基因具有PD-L1重合峰,并且发现多种转录因子具有全新的PD-L1...
不同肿瘤样本的RNA-seq分析发现PD-1high eTreg细胞中与糖酵解有关的基因及MYC靶基因表达上调,进一步验证后发现TME中肿瘤细胞的糖酵解活性与eTreg细胞中PD-1的表达存在正相关性。CD4+ T细胞与CD8+ T细胞比例是机体免疫状态的重要指标,而TME内CD8+ T细胞PD-1的表达水平与CD4+ eTreg细胞相比显著降低。接下来,...
在机制研究方面,分析RNA-seq结果后发现,敲除DENR后肿瘤细胞PD-L1 mRNA水平显著降低,同时伴随IFNγ-JAK-STAT信号通路受损。对DENR敲除细胞JAK-STAT通路进行WB检测,发现JAK2的蛋白水平显著降低,而mRNA水平不受影响。进一步研究发现JAK2的5’UTR中存在3个上游阅读框(uORF)序列,通过荧光报告实验、Ribo-qPCR和Ribo-seq数据...