Select language Download Expand all | Collapse all Details Version: V 1.1 Date Published: 5/12/2016 File Name: NCBI Blast on Windows Azure_V1.1.zip File Size: 62.5 MB A parallel BLAST engine that runs on the Windows Azure cloud fabric, NCBI BLAST on Windows Azure can scale up to hundred...
1、访问NCBI-BLAST 在线比对网址 访问NCBI-BLAST网址(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi),并根据查询序列的类型(蛋白或核酸)来选择使用的比对方法 2、在线进行序列比对 2.1 在线进行两序列比对 选择进行多序列比对,粘贴或者上传需要比对的序列,依次指定查询序列和参考序列,点击BLAST进行比对。 应用场景:查询...
首先进行Blast类型的选择: blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询; blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询; blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,然后将翻译结果对蛋白质序列数据库...
NCBI Blast installer is a tool from Avalanche NextGen biology software package that automatically downloads and installs the latest NCBI Blast+ edition in your computer. How to use it Start NCBI Blast Installer. Press 'Check for latest version' to see if a new Blast version is available on...
ncbi-blast-dbs is faster than NCBI's update_blastdb.pl. But unlike update_blastdb.pl, which is a pure Perl script, ncbi-blast-dbs delegates download and checksum verification to wget and md5sum / md5 and is thus not as universal. Installation gem install ncbi-blast-dbs Usage List availa...
NCBI在线版Blast使用(超详细奥) 首先进行Blast类型的选择: blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询; blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询; blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,...
首先进行Blast类型的选择: blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询; blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询; blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,然后将翻译结果对蛋白质序列数据库...
下载内容见https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/v5/nt-nucl-metadata.json #首先要写一个nt_ftp_download.list,这里面包含nt-nucl-metadata.json中提到的每一个nt.*.tar.gz,类似于:/blast/db/nt.015.tar.gz.md5/blast/db/nt.016.tar.gz.md5/blast/db/nt.003.tar.gz.md5/blast/db/nt.004.tar...
先了解BLAST Databases:BLAST FTP Site 如何下载NCBI blast数据库? NCBI提供了一个非常智能化的脚本update_blastdb.pl来自动下载所有blast数据库。 脚本使用方法: perlupdate_blastdb.pl nr 有哪些可供下载的blast数据库? perlupdate_blastdb.pl --showall ...
在Alignments界面下,有每一个比对结果的多序列比对结果展示。点击“Download”可以下载比对结果,也可以点击“gene bank”了解比对结果的详细信息。 Taxonomy界面主要告诉我们所比对的序列在分类学上是什么物种。 到这里,比对结果就展示完了。但是,如果您还不理解某些参数的具体含义,也不要紧。NCBI也有对BLAST的官方说明,...