Select language Download Expand all | Collapse all Details Version: V 1.1 Date Published: 5/12/2016 File Name: NCBI Blast on Windows Azure_V1.1.zip File Size: 62.5 MB A parallel BLAST engine that runs on the Windows Azure cloud fabric, NCBI BLAST on Windows Azure can scale up to hundred...
首先进行Blast类型的选择: blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询; blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询; blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,然后将翻译结果对蛋白质序列数据库...
这里以常用的BLAST中Nucleotide BLAST作为例子讲解(点击Nucleotide BLAST进入比对界面)。 2,粘贴fasta格式的序列(可以是多条奥!!,本处找到我们的测试例子~/Bioinformatic/Beginner/7.Align/01.Local_align/NAC.cds.fasta)。选择一个要比对的数据库,如果是人和鼠则进行相应的选择,否则选择Others中的nr/nt(nr:所有的...
要是保存网页的话，点显示器上的转换按钮就能保存为PDF文件。
ncbi-blast-dbs is faster than NCBI's update_blastdb.pl. But unlike update_blastdb.pl, which is a pure Perl script, ncbi-blast-dbs delegates download and checksum verification to wget and md5sum / md5 and is thus not as universal. Installation gem install ncbi-blast-dbs Usage List availa...
NCBI在线版Blast使用(超详细奥) 首先进行Blast类型的选择: blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询; blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询; blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,...
首先进行Blast类型的选择: blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询; blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询; blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列,然后将翻译结果对蛋白质序列数据库...
BLAST是生命科学研究中常用的一套在蛋白质数据库或核酸数据库中进行序列相似性比对的一套分析工具。英文全称是Basic Local Alignment Search Tool。NCBI作为生命科学研究领域使用最为广泛的数据库之一,深受广大科研工作者青睐。辉骏生物给大家简单介绍一下NCBI上的blast比对。 NCBI上的blast分为四种:Nucleotide ...
下面以最基本的核酸序列比对来谈一下blast 的使用,期间我也会说一下其他序列比对的方法。 2 点击basic blast 部分的nucleotide blast 链接到一个新的页面。打开后如图所示: 介绍一下上述页面: enter 19、query sequence 部分是让我们输入序列的,你可以直接把序列粘贴进去,也可以上传序 列,还可以选择你要比对的...
下载内容见https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/v5/nt-nucl-metadata.json #首先要写一个nt_ftp_download.list,这里面包含nt-nucl-metadata.json中提到的每一个nt.*.tar.gz,类似于:/blast/db/nt.015.tar.gz.md5/blast/db/nt.016.tar.gz.md5/blast/db/nt.003.tar.gz.md5/blast/db/nt.004.tar...