“Variation in miRNA”部分则介绍了在miRNA种子区域的SNP数目,成熟miRNA的SNP数目,在种子区域中与疾病相关的SNP数目(DRV)以及在成熟miRNA中,与疾病相关的SNP数目。 然后也展示了hsa-miR-10b-5p在各种肿瘤中的表达量,以及在CCLE和NCI60细胞系数据库中,药物敏感性与miRNA表达量的相关性,并显示了最为显著地几个药物...
MirSNP数据库就是一个存储了miRNA相关SNP位点的数据库,网址如下 http://bioinfo.bjmu.edu.cn/mirsnp/search/ 该数据库中包含两种miRNA相关的SNP位点,一种是位于pre-miRNA的gene上的SNP位点,这些SNP位点直接对miRNA的生成产生影响,分析过程示意如下 直接根据miRNA前体基因的染色体位置进行查找,筛选出位于该区域的SNP位...
今天给大家介绍的是另外一个miRNA SNP与疾病相关的数据库,哈尔滨医科大学李霞教授组出品的MSDD(miRNA SNP Disease Database),网址是bio-bigdata.hrbmu.edu.cn。相关文章发表于2017年发表在Nucleic Acids Research。与之前不同的是,MSDD是经过人工整理的,从
PolymiRTS 数据库是一个miRNA 相关snp 位点的数据库,链接如下: http://compbio.uthsc.edu/miRSNP/ 数据库中收录的snp位点可以分成两种: 1)snp 位点发生在 mRNA 上,包括实验支持和预测的miRNA-mRNA 靶标关系 2)snp 位点发生在 miRNA 上,miRNA seeds 这个数据库不仅记录了snp位点,而且还将snp位点和疾病,性状关...
miRNASNP数据库构建与使用 miRNASNP数据库构建与使用评分: miRNASNP数据库构建与使用,柳纯洁,郭安源,MicroRNAs(miRNAs)被认是因表达重要调控原件通过特异合信使RNA(mRNA)的3'非编码区域(3'UTR),参众多生物过程单核苷酸多态性(SNPs)是指因组上特� 首发论文2020-01-02 上传大小:975KB...
lncRNASNP数据库收集整理了人和小鼠中位于lncRNA基因上的SNP位点信息,通过以下两种思路将lncRNA与SNP结合起来 探究SNP位点对于lncRNA结构的影响 分析SNP位点对于lncRNA与miRNA结合的影响 除此之外,还提供了lncRNA,SNP在TCGA数据库中的相关信息,比如lncRNA在各种肿瘤中的表达谱,SNP位点在各种疾病中的突变情况。该数据库...
IncRNASNP 是提供人、小鼠长链非编码RNA(lncRNA)中单核苷酸多态性(SNP)的全面资源的数据库。该数据库由华中科技大学研究人员开发的专门收录lncRNA和SNP关联信息的数据库,它包含lncRNA中的SNP位点,探究SNP对lncRNA结构的影响,lncRNA中的突变以及lncRNA:miRNA结合,分析SNP位点对于lncRNA与miRNA结合的影响。lncRNASNP2...
在SNP研究领域,通过GWAS或者eQTL等手段,发现了大量与疾病或者某种复杂性状相关的SNP位点,而这些SNP的具体功能还需要进一步分析和挖掘。有科学家发现,SNP位点可以通过影响miRNA,从而引起疾病的发生与发展,所以研究miRNA相关的SNP位点是非常有意义的。 MirSNP数据库就是一个存储了miRNA相关SNP位点的数据库,网址如下 ... ...
该数据库中包含两种miRNA相关的SNP位点,一种是位于pre-miRNA的gene上的SNP位点,这些SNP位点直接对miRNA的生成产生影响,分析过程示意如下 直接根据miRNA前体基因的染色体位置进行查找,筛选出位于该区域的SNP位点。 另外一种就是一开始讨论的位于miRNA集合区域的SNP位点,这些SNP位点可能会对miRNA与mRNA的结合造成影响, 分析...
lncRNASNP数据库收集整理了人和小鼠中位于lncRNA基因上的SNP位点信息,通过以下两种思路将lncRNA与SNP结合起来 探究SNP位点对于lncRNA结构的影响 分析SNP位点对于lncRNA与miRNA结合的影响 除此之外,还提供了lncRNA,SNP在TCGA数据库中的相关信息,比如lncRNA在各种肿瘤中的表达谱,SNP位点在各种疾病中的突变情况。该数据库...