今天给大家讲一下如何构建构建WGCNA miRNA-mRNA共表达网络。 第一步,分别在TCGA上下载mRNA和miRNA数据 第二步,分别提取相应表达矩阵 第三步,分别做miRNA和mRNA的差异表达分析 第四步,将mRNA和miRNA合并为一个矩阵 第五步,WGCNA分析 第六步,Cytoscape构建共表达网络 希望本文对大家有所帮助,本文来源于微信公众号SCI...
课时08.构建miRNA与mRNA共表达网络是Cytoscape与生信数据挖掘,研究生利用生信发表SCI的第8集视频,该合集共计8集,视频收藏或关注UP主,及时了解更多相关视频内容。
服务详情 言行生物提供各种miRNA/lncRNA/环状RNA/mRNA的共表达网络图,可以进行关联分析,从多层次深入阐述分子机制。 结果展示 1、miRNA和mRNA共表达网络图 2、lncRNA和mRNA共表达网络图 3、mRNA共表达网络图首页 联系我们 留言板 第三代测序服务 代谢组学服务 生物信息学服务 蛋白质组学服务 CRISPR/...
现有的研究结果显示,异常的miRNA-mRNA相互作用参与OEM的发病机制和进展。本研究旨在通过对失调的miRNA-mRNA共表达网络的综合生物信息学分析,以鉴定OEM中的关键miRNA。 2 技术路线1. 配对OEM患者及健康志愿者的mRNA图谱 研究共纳入5例OEM患者配对的异位内膜(EC)和在位内膜(EU)组织和3例健康志愿者的正常子宫内膜组织,...
今天给大家讲一下如何构建构建WGCNA miRNA-mRNA共表达网络。 第一步,分别在TCGA上下载mRNA和miRNA数据 第二步,分别提取相应表达矩阵 第三步,分别做miRNA和mRNA的差异表达分析 第四步,将mRNA和miRNA合并为一个矩阵 第五步,WGCNA分析 第六步,Cytoscape构建共表达网络 ...
miRNA及mRNA的表达差异.利用wGCNA计算上述差异基因在1100例乳腺癌样本中表达的相关性并构建共表达网络.通过排列网络中基因与基因连接的数量关系分别筛选出关键的lncRNA,miRNA及mRNA,并利用本地标本库乳腺癌样本对关键基因在癌和癌旁的表达进行验证.最后,结合TCGA的临床资料采用Kaplan—Meier分析不同表达患者的生存率差异....
摘要 目的研究盾叶冠心宁片抗ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化的作用及机制。方法40只ApoE-/-小鼠随机分为空白组、模型组、可定组、盾叶组,每组10只。空白组给予基础饲料,其余各组均...展开更多 作者 李艳霞 李益萍 王肖龙 机构地区 上海中医药大学附属曙光医院 出处 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期...
今天给大家讲一下如何构建构建WGCNA miRNA-mRNA共表达网络。 第一步,分别在TCGA上下载mRNA和miRNA数据 第二步,分别提取相应表达矩阵 第三步,分别做miRNA和mRNA的差异表达分析 第四步,将mRNA和miRNA合并为一个矩阵 第五步,WGCNA分析 第六步,Cytoscape构建共表达网络 ...