lncRNA 可以作为竞争性内源 RNA(ceRNA)与其他蛋白质编码 RNA 转录物相互作用,包括转录因子(TF)和非TF基因.。在此把基因称为蛋白质编码基因,以便与非编码基因分开。通过与mRNA共享共同的miRNA结合位点或引导miRNA降解,lncRNA通过与miRNA相互作用与miRNA靶基因(TF或非TF基因)竞争。尽管lncRNA在癌症中发挥重要作用,但...
为深入探究调控miRNA转录的TF，研究团队从ChIP Atlas 3.0平台中获取了5个物种的TF结合峰值区域，包括人、小家鼠、褐鼠、黑腹果蝇和秀丽隐杆线虫；并确定了5个物种的miRNA启动子区域；使用BEDTool提取TF结合区和miRNA启动子之间的交叉点，从而获得了预测的TF-miRNA调控对。最后，根据miRNA启动子的置信度将预测的TF-...
大家在做研究的时候也可以借鉴下面这篇文章它就完美的体现了上面提到的三大招作者首先筛选出来lncrnaheih再依次找到了与之相关的18个基因图中绿色的基因是与肿瘤生长和耐药性相关所以作者推测lncrnaheih也与肿瘤生长和耐药性相关 lncRNA,miRNA,TF的研究思路–GCBI学院 调控表达中相关的lncRNA,miRNA,TF应该如何去研究,...
最近,基于寡核苷酸的PROTAC引起了人们的关注,特别是用于降解转录因子(TF)和RNA结合蛋白(RBP)。然而,转录因子通常参与许多基因表达,这导致寡核苷酸/转录因子的不利特异性和亲和力,需要高浓度的基于寡核苷酸的PROTAC。在这项最新研究中,研究团...
TransmiR是收集转录因子(TF)-microRNA(miRNA)的数据库,通过它我们可以找到TF和miRNA之间的调控关系。现在TransmiR已经升级到2.0版本,从1045个出版物中手动整理了2852个TF-miRNA条目,并包括了源自ChIP-seq的TF-miRNA数据。目前,ransmiR v2.0包含3,730个文献策划的TF-miRNA法规,涵盖约623个TF,约785个miRNA,19种生物和...
谢谢楼下的回答,为了得到更准确的答案,补充如下:miRNA能直接降解TF,如形成复合物等? 扫码下载作业帮搜索答疑一搜即得 答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 TF是转录因子,调控转录产物的,可以是mRNA,也是非编码RNA(例如miRNA),也可是其他.miRNA也可以作用于mRNA,影响mRNA的表达.反正,应该是一个调控的网络. 解析...
调控网络基于pubmedmeshkegg等数据库将已经有文献报道数据挖掘以及数据库中的基因与基因mirnatflncrna的调控关系进行了整理组成了现有的调控网络 一键获取基因的TF,miRNA、lncRNA及上下游基因调控网络–GCBI学院 在做基因研究的时候,有时是不是苦于寻找其上下游调控基因,TF,miRNA等。数个数据库,N篇文献来回翻,才能辛...
mRNA可以翻译成各种功能的蛋白,其中有一类研究调控蛋白研究的非常火热,即转录因子transcription factor, 简称TF,TF参与调控转录起始过程,是研究转录调控必不可少的一环。miRNA可以与mRNA结合,发挥转录后调控功能, 二者都是生物体内调控网络中的重要组成部分。
mRNA可以翻译成各种功能的蛋白,其中有一类研究调控蛋白研究的非常火热,即转录因子transcription factor, 简称TF,TF参与调控转录起始过程,是研究转录调控必不可少的一环。miRNA可以与mRNA结合,发挥转录后调控功能, 二者都是生物体内调控网络中的重要组成部分。
乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 乳腺癌TF-miRNA-BCCG调控网络 研究背景：microRNA Exportin5 •microRNA（简称miRNA)是一类内源的，长度约为21~25nt，与转录后基因沉默相关的非编码小分子RNA。在动物，其主要通过miRNA5’端的2-8nt的种子序列与靶标基因mRNA的3’端非编码区（3’UTR）不完全互补，进而抑制蛋白质...