本研究通过MeRIP-seq分析,研究人员发现在LW和NX猪肌肉中存在差异表达基因,并且这些基因主要富集在蛋白质合成通路中。联合分析MeRIP-seq和RNA-seq数据,鉴定出27个差异表达且m6A修饰基因,其中WFS1基因在LW和NX猪中通过m6A修饰被差异调控。研究人员进一步揭示了m6A修饰通过YTHDF2依赖性方式加速WFS1降解。并识别了一个SNP...
易基因科技为本研究提供MeRIP-seq和RNA-seq技术服务。 @易基因科技 研究方法 研究结果 将6只100日龄的雌性三黄鸡根据腹部脂肪比例被分为高脂组(n=3)和低脂组(n=3),并对其腹部脂肪组织进行MeRIP-seq和RNA-seq分析。通过对MeRIP-seq和RNA-seq组学数据的综合分析,鉴定出16个与m6A修饰相关的差异表达基因。其中包...
关于易基因RNA m6A甲基化测序(MeRIP-seq)技术 易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应...
本研究通过MeRIP-seq分析,研究人员发现在LW和NX猪肌肉中存在差异表达基因,并且这些基因主要富集在蛋白质合成通路中。联合分析MeRIP-seq和RNA-seq数据,鉴定出27个差异表达且m6A修饰基因,其中WFS1基因在LW和NX猪中通过m6A修饰被差异调控。研究人员进一步揭示了m6A修饰通过YTHDF2依赖性方式加速WFS1降解。并识别了一个SNP...
对MeRIP-seq和RNA-seq数据进行联合分析,共鉴定出27个差异表达且m6A修饰基因。还鉴定出一种典型的肌肉特异性包膜跨膜蛋白WFS1,在LW和NX猪中通过m6A修饰被差异调控,进一步揭示了m6A修饰以YTHDF2依赖方式加速了WFS1降解。最后鉴定了WFS1最后一个外显子中的C21551T导致m6A甲基化变化,从而影响LW和NX猪中的WFS1表达...
对MeRIP-seq和RNA-seq数据进行联合分析,共鉴定出27个差异表达且m6A修饰基因。还鉴定出一种典型的肌肉特异性包膜跨膜蛋白WFS1,在LW和NX猪中通过m6A修饰被差异调控,进一步揭示了m6A修饰以YTHDF2依赖方式加速了WFS1降解。最后鉴定了WFS1最后一个外显子中的C21551T导致m6A甲基化变化,从而影响LW和NX猪中的WFS1表达...
(3)MeRIP-seq和mRNA-seq联合分析表明,LCAT的mRNA甲基化可能调控脂肪沉积。 (4)ALKBH5作为一种去甲基化酶,介导LCAT的降解并影响其稳定性 (5)LCAT抑制脂肪前体细胞增殖 (6)LCAT通过PPARγ通路促进脂肪前体细胞分化 研究结论 本研究结果表明,低脂组中LCAT表达和m6A甲基化修饰水平均下调。研究还揭示了ALKBH5与LCAT的相...
将6只100日龄的雌性三黄鸡根据腹部脂肪比例被分为高脂组(n=3)和低脂组(n=3),并对其腹部脂肪组织进行MeRIP-seq和RNA-seq分析。通过对MeRIP-seq和RNA-seq组学数据的综合分析,鉴定出16个与m6A修饰相关的差异表达基因。其中包括与脂肪形成相关的ELOVL脂肪酸延伸酶2(ELOVL2)、丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)、脂肪酸结合...
对MeRIP-seq和RNA-seq数据进行联合分析,共鉴定出27个差异表达且m6A修饰基因。还鉴定出一种典型的肌肉特异性包膜跨膜蛋白WFS1,在LW和NX猪中通过m6A修饰被差异调控,进一步揭示了m6A修饰以YTHDF2依赖方式加速了WFS1降解。最后鉴定了WFS1最后一个外显子中的C21551T导致m6A甲基化变化,从而影响LW和NX猪中的WFS1表达...