为理解m6A RNA甲基化在脂肪代谢中的作用提供了新的视角,并可能有助于开发改善家禽脂肪沉积策略。 关于易基因RNA m6A甲基化测序(MeRIP-seq)技术 易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可...
从机制上讲,ALKBH5基因高表达调控LCAT RNA去甲基化并影响LCAT mRNA稳定性。此外,LCAT抑制脂肪前体细胞(preadipocyte)增殖并促进脂肪前体细胞分化,在脂肪形成中发挥关键作用。 重要图形: (1)高脂组和低脂组家禽腹部脂肪组织进行MeRIP-seq分析 (2)mRNA-seq鉴定与脂肪沉积相关的mRNA (3)MeRIP-seq和mRNA-seq联合分析表明...
关于易基因RNA m6A甲基化测序(MeRIP-seq)技术 易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应...
关于易基因RNA m6A甲基化测序(MeRIP-seq)技术 易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),结合高通量测序,可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量,总RNA起始量可降低至10μg,最低仅需1μg总RNA。广泛应用于组织发育、干细胞自我更新和分化、热休克或DNA损伤应...
对MeRIP-seq和RNA-seq数据进行联合分析,鉴定出612个m6A peaks和RNA表达异常调控基因。KEGG分析鉴定出612个基因在癌症相关信号通路中富集,包括cGMP-PKG信号通路和Rap1信号通路。GSEA富集分析表明,这些基因在细胞周期相变、细胞分裂、细胞对DNA损伤刺激响应和染色体组织中富集。
研究首先基于家禽腹部脂肪比例将100日龄雌性三黄鸡分为高脂组和低脂组,并利用MeRIP-seq和RNA-seq技术对两组的腹部脂肪组织进行分析,以鉴定与脂肪形成相关的m6A修饰差异基因。进一步通过细胞实验研究ALKBH5对LCAT mRNA去甲基化及稳定性的影响。本研究揭示了ALKBH5通过去甲基化调控LCAT mRNA稳定性,并影响家禽脂肪形成。
对MeRIP-seq和RNA-seq数据进行联合分析,鉴定出612个m6A peaks和RNA表达异常调控基因。KEGG分析鉴定出612个基因在癌症相关信号通路中富集,包括cGMP-PKG信号通路和Rap1信号通路。GSEA富集分析表明,这些基因在细胞周期相变、细胞分裂、细胞对DNA损伤刺激响应和染色体组织中富集。
从机制上讲,ALKBH5基因高表达调控LCAT RNA去甲基化并影响LCAT mRNA稳定性。此外,LCAT抑制脂肪前体细胞(preadipocyte)增殖并促进脂肪前体细胞分化,在脂肪形成中发挥关键作用。 重要图形 (1)高脂组和低脂组家禽腹部脂肪组织进行MeRIP-seq分析 (2)mRNA-seq鉴定与脂肪沉积相关的mRNA (3)MeRIP-seq和mRNA-seq联合分析表明...
研究首先基于家禽腹部脂肪比例将100日龄雌性三黄鸡分为高脂组和低脂组,并利用MeRIP-seq和RNA-seq技术对两组的腹部脂肪组织进行分析,以鉴定与脂肪形成相关的m6A修饰差异基因。进一步通过细胞实验研究ALKBH5对LCAT mRNA去甲基化及稳定性的影响。本研究揭示了ALKBH5通过去甲基化调控LCAT mRNA稳定性,并影响家禽脂肪形成。
中文题目:MeRIP-seq 和 RNA-seq以及蛋白质组学的联合分析解析 原文题目:Refined RIP-seqprotocalfor epitranscriptomeanalysis with low input materials 期刊及发表时间:PLOS,2018 主要内容: 对2个肺腺癌患者肿瘤的m6A数据、RNA-seq数据和MS数据进行联合分析,确定了18个m6A水平存在差异、mRNA和蛋白水平变化不一致的基因...