该研究为进一步理解家禽脂肪沉积中的RNA甲基化调控机制提供理论基础。易基因科技为本研究提供MeRIP-seq和RNA-seq技术服务。 研究方法 研究结果 将6只100日龄的雌性三黄鸡根据腹部脂肪比例被分为高脂组(n=3)和低脂组(n=3),并对其腹部脂肪组织进行MeRIP-seq和RNA-seq分析。通过对MeRIP-seq和RNA-seq组学数据的综合...
维恩图展示通过RNA-seq和MeRIP-seq检测的显著表达或m6A峰变化(FDR<0.05, p<0.05)的基因数量。 DMSO和STM2457组中差异m6A标记基因热图。 在DMSO与STM2457组中,m6A峰和mRNA表达水平显著变化的基因被分为4类:hypo-down(m6A峰下调,mRNA下调);hypo-up(m6A峰下调,mRNA上调);hyper-down(m6A峰上调,mRNA下调);hyper-u...
通过对MeRIP-seq和RNA-seq组学数据的综合分析,鉴定出16个与m6A修饰相关的差异表达基因。其中包括与脂肪形成相关的ELOVL脂肪酸延伸酶2(ELOVL2)、丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)、脂肪酸结合蛋白9(PMP2)、脂肪酸结合蛋白1(FABP1)、溶酶体相关膜蛋白3(LAMP3)、卵磷脂胆固醇酰基转移酶(LCAT)和溶质载体家族2成员1(SLC2A1...
此外,研究人员对单侧输尿管结扎后3天的UUO小鼠肾脏进行了甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-seq)分析。KEGG富集分析表明m6A甲基化与炎症通路密切相关。为了确定METTL3在肾脏炎症中的特异性靶标,研究人员对TNF-α刺激的HK2细胞(METTL3沉默or未沉默)进行MeRIP-seq和RNA-seq分析。MeRIP-seq分析显示,m6A修饰通常位于共有的“...
技术平台:MeRIP-seq、RNA-seq、荧光素酶报告基因实验等 研究摘要: 骨质疏松症对公众健康有着深远的影响。一线用药双膦酸盐常引起颌骨坏死,同时抑制破骨细胞。因此,开发有效的治疗方法非常重要。本研究结果表明,以4249A为功能位点的唑来膦酸(zoledronic acid,ZOL)导致的NFATc1 m6A甲基化水平升高与破骨细胞骨吸收能力...
技术平台:MeRIP-seq、RNA-seq、荧光素酶报告基因实验等 研究摘要: 骨质疏松症对公众健康有着深远的影响。一线用药双膦酸盐常引起颌骨坏死,同时抑制破骨细胞。因此,开发有效的治疗方法非常重要。本研究结果表明,以4249A为功能位点的唑来膦酸(zoledronic acid,ZOL)导致的NFATc1 m6A甲基化水平升高与破骨细胞骨吸收能力...
2023年10月30日,宾夕法尼亚大学生物系Brian D. Gregory团队等在《The Plant Cell》期刊发表标题为“Pathogen-induced m6A dynamics affect plant immunity”的研究论文,文章主要通过MeRIP-seq和RNA-seq等分析探讨了植物在生物胁迫下,尤其是病原体感染时,m6A修饰在植物免疫中的作用。
技术平台: MeRIP-seq(m6A);RNA-seq等 研究摘要: 腺嘌呤(N6-甲基腺苷(m6A))N6 位甲基化介导的 mRNA 转录后调控对植物转录组调控具有深远影响。对真核生物的重点研究得以了解 m6A 在整个发育和疾病状态中的调控过程。然而对植物生物胁迫期间 m6A 的动态和调节潜力缺乏了解。本研究全面分析了 m6A 对拟南芥 (Arabido...
2022年8月11日,南方科技大学王玉琨教授团队以“Comprehensive Analysis of the Transcriptome-wide m6A Methylome in Lung Adenocarcinoma by MeRIP Sequencing”为题在《Frontiers in Oncology》杂志上发表研究论文,通过MeRIP-seq和对应的转录组测序(RNA-seq)联合分析验证了m6A甲基化修饰与肺腺癌(LUAD)进展之间的强关联。
(F、G、H、I)m6A 修饰和 RNA 水平均发生显著变化基因的GSEA富集图。 表2:肿瘤组和正常组m6A-seq&RNA-seq的前20个差异基因 (4)鉴定含有m6A修饰的2个基因与LUAD患者的临床参数相关 图5:m6A修饰调控的基因表达与TCGA数据库中临床参数的关系 本研究中的基因与 TCGA 数据库的交集。前20 个基因的单变量 Cox ...