学徒第2月,RNA-seq数据分析实战训练:文档链接:https://mubu.com/doc/38y7pmgzLg 密码:p6fo 学徒第4月,ChIP-seq数据分析实战训练:文档链接:https://mubu.com/doc/11taEb9ZYg 密码:wk29 其中ChIP-seq数据分析 拿到了peaks后跟文章的GSE130032对比,然后表达量矩阵就没办法跟原文对比了,他没有给出。 接下来...
rnaseq是看表达的，chipseq是看蛋白在dna上的结合位点的，硬要说优点的话rna富集可能要容易些ChIP-seq...
该研究通过转录组测序(RNA-seq)和染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)联合揭示精子组蛋白修饰H3K4me3可能作为一种代谢传感器,通过胞衣将父方的饮食与后代的表型联系起来。
本研究通过整合RNA测序、蛋白质组学分析、ChIP-seq、ATAC-seq数据以及实验验证,有力地支持了如下理论:AP2XII-1和AP2XI-2蛋白能够形成同源或异源二聚体,并通过与裂殖子基因启动子区域结合,进而招募MORC和HDAC3蛋白,最终实现对速殖子中裂殖子特异性基因的沉默。具体而言,MORC能够进一步组装成二聚体结构,在拓扑结构...
主要技术:ChIP-seq,EMSA,微尺度热泳分析,RNA-seq, RT-qPCR 近日,中山大学深圳校区制药科学学院邓音乐教授研究团队在Cell Reports上发表了题为“Regulation of Burkholderia cenocepacia virulence by the fatty acyl-CoA ligase DsfR as a response regulator of quorum sensing signal” 的研究论文,该研究以伯克霍尔德...
因为是表观联合分析,所以全文分成两部分,ChIP-seq和RNA-Seq首先是各自独立处理,然后是合并分析 RNA-seq分析 数据下载 手动安装aspera,我用conda安装老报错,于是改用手动下载然后直接安装即可。 wget https://ak-delivery04-mul.dhe.ibm.com/sar/CMA/OSA/09cne/0/ibm-aspera-connect-3.11.0.5-linux-g2.12-64....
RNA-seq 和ChIP-seq数据关联分析生物实验 定制分析 多组学整合分析 SCI论文科研技术支持服务 文献检索查新及研究进展报告服务 其他优质服务 实验介绍 服务流程 送样要求 参考文献 留言咨询 ChIP-Seq 的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术( ChIP )特异性地富集目的蛋白A结合的 DNA 片段,并对其进行纯化与文库构建;...
BETA整合ChIPseq和RNAseq 前些天,生信技能树表观转录调控之ChIP-seq和RNA-Seq联合分析介绍了一篇文献取ChIP-seq和RNA-seq数据的交集进行联合分析,小编在底下留言提到了刘Shirley实验室出品的几款整合分析工具,其中有一个BETA软件。本文就此工具做一个使用介绍。
BETA是RNA-seq和ChIP-seq联合分析的工具。BETA适用于哺乳动物,人或者老鼠转录因子的分析。在哺乳动物实验系统中,基因表达变化和转录因子结合之间的一致性通常很难解释。首先,因子结合位点和靶基因通常缺乏一对一的关系。相同的因子可以结合在近端启动子也可以在下游数百千碱基之间的任何位置来调控基因的表达。或者,同一...
1. 背景: ChIP-Seq 的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术( ChIP )特异性地富集目的蛋白A结合的 DNA 片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的 DNA 片段进行高通量测序。研