MeRIP-seq是用于检测RNA上m6A修饰的技术,结合高通量测序对m6A修饰进行定位与定量。 MeRIP-seq是用于检测RNA上m6
MERIP-seq的原理是,首先将RNA样品切成短片段,然后使用m6A特异性抗体选择性地富集m6A修饰的RNA片段。富集后的RNA片段可以通过RNA测序进行分析,以确定m6A修饰的位置和丰度。 MERIP-seq的主要优点是,它可以检测特定RNA上的m6A修饰,因此可以提供更准确的信息。此外,它可以在较短的时间内分析大量的RNA样品。然而,这种方法也...
随后,MeRIP-seq/m6A-seq实验方法的建立使得有机会对该修饰的分布和功能进行深入研究[1]。 利用MeRIP-seq/m6A-seq技术鉴定全基因组范围内具有m6A修饰的区域。其原理为通过特异识别m6A修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,结合生物信息学分析,即可在全基因组范围...
2. merip-seq技术的原理 merip-seq技术是以m6A修饰的特异性抗体为基础的RNA测序方法。该技术首先利用抗m6A抗体特异性地结合m6A修饰的RNA分子,然后通过抗体-RNA复合物的沉淀和纯化,将m6A修饰的RNA分子与未修饰的RNA分子进行分离。接下来,对分离得到的m6A修饰的RNA分子进行测序分析,从而得到m6A修饰的RNA的鉴定和定位信息...
一、技术原理：甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验基于表观转录组学，研究RNA上的化学修饰如何调节基因表达。m6A修饰，即腺苷酸N6位的甲基化，是mRNA上含量最高的修饰，参与mRNA的生命周期，如稳定性调控、RNA结构调控和microRNA靶标识别等。m6A修饰主要富集在终止密码子和3’UTR附近，通过特定...
对干扰与过表达的GSC28细胞进行RNA-seq。KEGG富集分析,发现31条通路,包括几种受体酪氨酸激酶(RTK)相关通路和肿瘤相关通路,提示MET404参与了多种癌变信号通路。在GSC28细胞中,circMET RNA的OE或MET404 ORF的OE增加了p-MET和下游信号水平以及生物学功能。在小鼠原位肿瘤发生实验中,MET404的KD抑制了小鼠脑肿瘤异种移植...
一、甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)测序技术原理 表观转录组研究中，m6A RNA甲基化修饰是重要现象之一。m6A主要发生在终止密码子和3’UTR附近，参与调控mRNA的稳定性、二级结构、microRNA靶标识别以及基因表达调控等。MeRIP-seq/m6A-seq技术通过特异识别m6A修饰的抗体，对细胞内具有m6A修饰的RNA...
MeRIP-qPCR就是MeRIP实验后进行一个qPCR。 这里的MeRIP实验同MeRIP-seq测序中的其实相同:对RNA进行片段化。然后每个样品一分为二,一部分片段用针对该修饰的特异性抗体与RNA片段进行免疫共沉淀(IP),留为IP样品,另一部分不进行IP直接留作Input样品。之后对两部分RNA片段分别进行逆转录和qPCR。如果是测序,就是在这里把...
优势三:MeRIP-seq全面升级,spike in严格质控IP实验 云序m6A meRIP-seq Plus(spike in)通过在实验过程中加入两类人工合成的spike in:阳性Spike-In(带m6A修饰)和阴性Spike-In(不带修饰),与样品一起进行MeRIP实验及后续测序分析,根据spike in的检测信号对MeRIP实验进行质控,确保实验流程的准确性、可重复性及抗体的特...
MeRIP-seq的原理 通过特异识别m6A修饰的抗体,对具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序。具体过程包括:RNA分子首先被片段化成约100-200nt的片段,通过抗体富集含有m6A修饰的RNA片段,然后进行二代转录组建库测序,作为IP样本反映该RNA片段上含有m6A修饰。同时,所有的RNA片段均会进行常规二代...