MeRIP-seq是用于检测RNA上m6A修饰的技术,结合高通量测序对m6A修饰进行定位与定量。 MeRIP-seq是用于检测RNA上m6
MERIP-seq的原理是,首先将RNA样品切成短片段,然后使用m6A特异性抗体选择性地富集m6A修饰的RNA片段。富集后的RNA片段可以通过RNA测序进行分析,以确定m6A修饰的位置和丰度。 MERIP-seq的主要优点是,它可以检测特定RNA上的m6A修饰,因此可以提供更准确的信息。此外,它可以在较短的时间内分析大量的RNA样品。然而,这种方法也...
MeRIP-seq将甲基化DNA 免疫共沉淀(methylated DNA immunoprecipitation, MeDIP)技术、RNA 结合蛋白免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)技术和RNA 测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术组合起来,高精度地检测全基因组(或全转录组)范围内的RNA甲基化。其原理为通过特异识别m6A修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行...
利用MeRIP-seq/m6A-seq技术鉴定全基因组范围内具有m6A修饰的区域。其原理为通过特异识别m6A修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀。对沉淀下来的RNA片段进行高通量测序,结合生物信息学分析,即可在全基因组范围内对m6A修饰的状况进行系统研究。MeRIP-seq/m6A- seq是目前研究m6A修饰使用最广泛的技术之一。
2. merip-seq技术的原理 merip-seq技术是以m6A修饰的特异性抗体为基础的RNA测序方法。该技术首先利用抗m6A抗体特异性地结合m6A修饰的RNA分子,然后通过抗体-RNA复合物的沉淀和纯化,将m6A修饰的RNA分子与未修饰的RNA分子进行分离。接下来,对分离得到的m6A修饰的RNA分子进行测序分析,从而得到m6A修饰的RNA的鉴定和定位信息...
图1:m6A甲基化和去甲基化示意图 目前对m6A的转录组研究方法为MeRIP-seq(mRNA甲基化测序)的方法,其原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。 服务...
MERIP-seq 方法是一种 RNA 剪接的高通量测序技术。它可以在整个转录组范围内同时鉴定和定量 RNA 剪接异构体。该方法的原理是利用抗体特异性地识别,并捕获 RNA 蛋白复合物,然后通过高通量测序技术对捕获的 RNA 进行测序。 MERIP-seq 方法的优点包括高效准确地测定 RNA 剪接异构体,以及可在细胞层面或组织层面进行分析...
MeRIP-seq原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析,即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。 m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中十分常见的一种甲基化修饰,同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影...
一、技术原理：甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验基于表观转录组学，研究RNA上的化学修饰如何调节基因表达。m6A修饰，即腺苷酸N6位的甲基化，是mRNA上含量最高的修饰，参与mRNA的生命周期，如稳定性调控、RNA结构调控和microRNA靶标识别等。m6A修饰主要富集在终止密码子和3’UTR附近，通过特定...