去年10月底,PacBio与麻省理工学院 Broad 研究所、哈佛大学以及 10x Genomics, Inc. 合作推出一款多重阵列测序 (MAS-Seq) 试剂盒,结合10x Genomics全长cDNA实现高通量低成本scIso-seq。 该试剂盒支持从10x Chromium Next GEM单细胞3 '试剂盒(v3.1)生成的cDNA,通过将16个cDNA串联成适配PacBio的文库大小,并在两侧...
PacBio MAS-Seq的主要特点：1. 支持由 10x Chromium Next GEM Single Cell 3' 试剂盒 (v3.1) 生成的 cDNA；2. cDNA 起始量为 15-75 ng；3. 相较于传统常规单细胞Iso-Seq文库，MAS-Seq将通量扩展了16倍；4. 突破传统基因水平研究，得到更多全长转录本信息；5. 在单细胞水平上，实现多样化全长转录本...
PacBio相信,如果将MAS-Seq测序技术扩展到Bulk RNA测序和16S rRNA等关键应用,也将为客户提供具有成本效益的成套解决方案和端到端软件。 PacBio公司总裁兼首席执行官Christian Henry表示:"自从我们去年10月份宣布推出第一个基于MAS-Seq的试剂盒以来,客户一直以来的需求是极其令人振奋的,甚至要求我们将该技术扩展到他们最...
使用PacBio Iso-Seq 测序方法可以捕获完整的转录亚型,但是因为通量有限,并没有被广泛应用,尤其是在单细胞转录组测序领域。为了解决这个问题,Broad研究所的研究人员开发了MAS-ISO-seq技术,这是一种以编程方式将互补DNA (cDNA)连接成最适合HiFi测序的检测长度的技术,能够将单细胞全长转录组测序通量提高了15倍以上。相...
基于单细胞分辨率下RNA同源异构体的精确量化仍然是一个严峻的挑战,MAS-ISO-seq技术通过程序性串联cDNA成单分子,可能在精确量化方面优于Pacbio测序技术。 二、实验设计 使用合成RNA同源异构体库验证了MAS ISO序列的可以明确同源异构体分配,并将此方法应用于肿瘤浸润性T细胞的单细胞RNA序列测定。
为解决以上问题,PacBio 推出了 MAS-Seq试剂盒,通过将短的 cDNA 进行串联建库的方式连接起来再进行HiFi测序,从而解决了长读长单细胞 RNA 测序的通量瓶颈。 PacBio MAS-Seq的主要特点:1. 支持由 10x Chromium Next GEM Single Cell 3' 试剂盒 (v3.1) 生成的 cDNA;2. cDNA 起始量为 15-75 ng;3. 相较于...
1. 技术产生背景 PacBio构建这种文库的一个主要原因是,在其测序芯片中有很多零模波导孔(ZMW),每个孔在测序时只能测一条DNA分子,这样其测序通量就受到孔数和文库长度...
多重阵列测序(MAS-Seq), 是PacBio联合10x Genomics推出的试剂盒,利用10x Genomics单细胞基因表达技术的工具包解决方案,实现低成本的长片段读取单细胞RNA测序。 该技术最初来源于2021年的一篇文献(High-throughput RNA isoform sequencing using programmable cDNA concatenation | bioRxiv),后经PacBio参考引入升级,以新...