1. 技术产生背景 PacBio构建这种文库的一个主要原因是,在其测序芯片中有很多零模波导孔(ZMW),每个孔在测序时只能测一条DNA分子,这样其测序通量就受到孔数和文库长度的限制。近些年PacBio确实也在不停的增加ZMW孔的数目,从而来提升通量,ZMW孔的数目也从刚开始的3千个,一路增加到15万个、100万个和800万个,即将...
PacBio MAS-Seq的主要特点：1. 支持由 10x Chromium Next GEM Single Cell 3' 试剂盒 (v3.1) 生成的 cDNA；2. cDNA 起始量为 15-75 ng；3. 相较于传统常规单细胞Iso-Seq文库，MAS-Seq将通量扩展了16倍；4. 突破传统基因水平研究，得到更多全长转录本信息；5. 在单细胞水平上，实现多样化全长转录本...
使用PacBio Iso-Seq 测序方法可以捕获完整的转录亚型,但是因为通量有限,并没有被广泛应用,尤其是在单细胞转录组测序领域。为了解决这个问题,Broad研究所的研究人员开发了MAS-ISO-seq技术,这是一种以编程方式将互补DNA (cDNA)连接成最适合HiFi测序的检测长度的技术,能够将单细胞全长转录组测序通量提高了15倍以上。相...
PacBio新技术MAS-seq-技术概况 多重阵列测序(MAS-Seq), 是PacBio联合10x Genomics推出的试剂盒,利用10x Genomics单细胞基因表达技术的工具包解决方案,实现低成本的长片段读取单细胞RNA测序。 该技术最初来源于2021年的一篇文献(High-throughput RNA isoform sequencing using programmable cDNA concatenation | bioRxiv)...
去年10月底,PacBio与麻省理工学院 Broad 研究所、哈佛大学以及 10x Genomics, Inc. 合作推出一款多重阵列测序 (MAS-Seq) 试剂盒,结合10×Genomics全长cDNA实现高通量低成本scIso-seq。 单细胞Iso-seq(scIso-seq)可以揭示单细胞全长转录本异构体(isoform),获得更高分辨率的转录组信息,深层次挖掘基因融合事件,但仍...
PacBio即日宣布启动一项计划,旨在将多重阵列测序(MAS-Seq)扩展到Sequel II/IIe和Revio™测序系统的新检测项目上。 PacBio(纳斯达克股票代码:PACB),一家领先的高质量、高精度测序解决方案开发商,即日宣布启动一项计划,旨在将多重阵列测序(MAS-Seq)扩展到Sequel II/IIe和Revio™测序系统的新检测项目上。这项计划...
PacBio products or technologies, including with respect to the potential expansion of MAS-Seq technology to new assays for use on the Sequel II/IIe and Revio systems; providing cost-effective kitted-solutions and end-to-end software by extending the MAS-Seq technology; plans to lau...
为解决以上问题,PacBio 推出了 MAS-Seq试剂盒,通过将短的 cDNA 进行串联建库的方式连接起来再进行HiFi测序,从而解决了长读长单细胞 RNA 测序的通量瓶颈。 PacBio MAS-Seq的主要特点:1. 支持由 10x Chromium Next GEM Single Cell 3' 试剂盒 (v3.1) 生成的 cDNA;2. cDNA 起始量为 15-75 ng;3. 相较于...
基于单细胞分辨率下RNA同源异构体的精确量化仍然是一个严峻的挑战,MAS-ISO-seq技术通过程序性串联cDNA成单分子,可能在精确量化方面优于Pacbio测序技术。 二、实验设计 使用合成RNA同源异构体库验证了MAS ISO序列的可以明确同源异构体分配,并将此方法应用于肿瘤浸润性T细胞的单细胞RNA序列测定。
基于MAS-ISO-seq方法学,PacBio现已推出针对单细胞全长转录组测序的建库试剂盒 MAS-seq kit。通过将短的10x Genomics cDNA 进行串联建库的方式连接起来再进行HiFi测序,从而解决了长读长单细胞RNA测序的通量瓶颈。 PacBio MAS-Seq的主要特点: 1. 支持由 10x Chromium Next GEM Single Cell 3' 试剂盒 (v3.1) ...