MAS-Seq测序技术通过将多个较短的片段串联起来,作为一个长的HiFi read在测序仪上进行读取,能将有效数据产量扩大16倍。而如果将MAS-Seq测序技术扩展到Bulk RNA测序和16S rRNA等关键应用,也将在转录组测序、16S测序等方面为客户提供更加具有成本效益的成套解决方案,大家敬请期待!
PacBio MAS-Seq的主要特点：1. 支持由 10x Chromium Next GEM Single Cell 3' 试剂盒 (v3.1) 生成的 cDNA；2. cDNA 起始量为 15-75 ng；3. 相较于传统常规单细胞Iso-Seq文库，MAS-Seq将通量扩展了16倍；4. 突破传统基因水平研究，得到更多全长转录本信息；5. 在单细胞水平上，实现多样化全长转录本...
PacBio相信,如果将MAS-Seq测序技术扩展到Bulk RNA测序和16S rRNA等关键应用,也将为客户提供具有成本效益的成套解决方案和端到端软件。 PacBio公司总裁兼首席执行官Christian Henry表示:"自从我们去年10月份宣布推出第一个基于MAS-Seq的试剂盒以来,客户一直以来的需求是极其令人振奋的,甚至要求我们将该技术扩展到他们最...
为了验证MAS-ISO-seq,使用cDNA文库进行测试,即对肿瘤浸润的CD8 + T细胞进行了10x Genomics 5’端单细胞测序,其中获得了6260个CD8 + T细胞,尽管二代和三代方法和定量方法在测序深度上存在较大差异,但细胞聚类和基因表达高度一致(图2)。利用T细胞分化过程中CD45(PTPRC)的不同剪接模式,使用 CITE-seq 在蛋白质水平...
就目前测序的酶读长,对于HiFi 15kb的文库数据,平均测序准确性可以达到QV30左右,即千分之一的错误率。如果文库较短,虽然可以获取更多的pass数,经过CCS矫正后具有较高的准确性,但是分子长度较短会使有效数据量变少,所以MAS-seq应运而生。 2. 文库构建过程...
多重阵列测序(MAS-Seq), 是PacBio联合10x Genomics推出的试剂盒,利用10x Genomics单细胞基因表达技术的工具包解决方案,实现低成本的长片段读取单细胞RNA测序。 该技术最初来源于2021年的一篇文献(High-throughput RNA isoform sequencing using programmable cDNA concatenation | bioRxiv),后经PacBio参考引入升级,以新...
scMaSigPro is an R package designed for analyzing single-cell RNA-seq data over pseudotime. Building on the maSigPro package, it identifies genes with significant expression changes across branching paths in a pseudotime-ordered dataset. This guide provides a step-by-step workflow for ScMaSig...
Conesa, 2014 Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time se- ries. Bioinformatics 30: 2598-2602. https://doi.org/10.1093/ bioinformatics/btu333Nueda, M.J.; Tarazona, S.; Conesa, A. Next maSigPro: updating maSigPro bioconductor package for RNA-seq time ...
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分析及建议: 可以考虑穿刺活检病理,如果担心就活检,,也可以观察一段时间,毕竟淋巴结比较小,应该问题不大的,,您的淋巴结比较小 活动度应该比较好,导致淋巴结肿大还可能是感染,那就活检,活检病理是诊断肿瘤金标准。 咨询时间: 2016-05-18 患者 我腹股沟淋巴结肿大,最大17×8,全身无力,三四个月体重减轻十几斤,...