m6A修饰RNA表达水平定量检测(MeRIP-qPCR)是将RNA免疫共沉淀与荧光定量PCR相结合的技术,通过特异性抗体富集total RNA中发生m6A甲基化修饰的RNA,借助特异性引物实现对m6A修饰的mRNA、lncRNA或circRNA进行定量的目的,可以应用于经MeRIP-seq发现的m6A修饰的基因(或已知的某个靶基因)在组间样本中m6A修饰水平的差异验证。
如果用数字来表示那就是input需要100ng,m6A在IP前需要1ug,IgG在IP前也需要1ug。 所以接下来我们就要详细讨论下m6A-IP-qPCR 是如何计算相对表达量的。 PART03 MeRIP-qPCR 是m6A-IP-qPCR 的另一种说法。所以从名称上我们就能发现,m6A-IP-qPCR基本和常规的RIP-qPCR相似。当然在讨论RIP-qPCR之前,我们先来看看常规...
所谓m6A-IP-qPCR也叫MeRIP-qPCR,即利用m6A抗体在富集到带甲基化修饰的RNA后,下一步使用qPCR直接对富集到的RNA进行定量的一种技术。 这种技术可以做到对发生甲基化的RNA进行相对定量,是一种低成本的检测方法,仅需m6A抗体,A/G免疫磁珠,磁力架和qPCR仪及配套试剂盒即可开展这类实验。 第一步提取total RNA,作为可选...
m6A绝对定量qPCR 简介 服务流程 N6-甲基腺嘌呤(m6A)是RNA中丰度最高的转录后修饰,在生物学过程中扮演重要角色。很多研究发现,各类RNA上单个m6A即可发挥重要功能。由于缺乏在精确位点鉴定m6A修饰的高灵敏度方法,使得m6A的功能研究很大程度上仍未得到探索。新研究发现,T3 DNA连接酶对m6A修饰有高度的敏感性。在此基础上...
高通量测序可以对所有被m6A抗体富集下来的RNA进行全转录层面的扫描分析,一旦m6A抗体有非特异性富集,在数据呈现上我们可以明显发现reads的分布比较乱且没有规律,而特异性富集则reads几乎富集在哺乳动物的3’UTR区和植物的5’UTR和3’UTR区。所以这就是测序不需要IgG文库,而我们做m6A-IP-qPCR 需要IgG富集的原因。但是...
Human GPM6A qPCR Primer Pair,即人GPM6A qPCR引物对,主要用于基于SYBR Green的qPCR、One-Step qRT-PCR或semi-quantitative PCR。本引物为预先设计、经过qPCR验证、预混的引物对。 qPCR (Quantitative PCR)即定量PCR,也称实时荧光定量PCR或实时定量PCR (Real-time quantitative PCR)、实时PCR (Real-time PCR),是一...
创新方法将 MeRIP 和m6A-CLIP 的优点与最快的程序结合起来,特别推出:m6A RNA甲基化片段富集试剂盒(qPCR版)【简称:MeRIP试剂盒】。 使用m6A RNA甲基化片段富集试剂盒富集m6A RNA,通过采用A-1801-m6A抗体从10ug人类总RNA和500ng 阳性对照oligo中富集包含m6A 片段的RNA。Non-immune IgG作为阴性对照.对富集后的RNA进...
Mouse Gpm6a qPCR Primer Pair,即小鼠Gpm6a qPCR引物对,主要用于基于SYBR Green的qPCR、One-Step qRT-PCR或semi-quantitative PCR。本引物为预先设计、经过qPCR验证、预混的引物对。 qPCR (Quantitative PCR)即定量PCR,也称实时荧光定量PCR或实时定量PCR (Real-time quantitative PCR)、实时PCR (Real-time PCR),是...
m6A RNA甲基化片段富集试剂盒(qPCR版) 简称:【MeRIP试剂盒】 此品非常适合从广泛的物种比如从哺乳类动物,植物,真菌和细菌,不仅如此,还包括培养细胞与新鲜和 冷冻的组织等感兴趣的样本中提取总RNA来富集片段化的含有m6A的RNA.少至500ng的总RNA也可开展. 整个实验时间不到3小时.手动操作不到30分钟. 目录号: A-...
艾德科技---m6A RNA甲基化片段富集试剂盒(qPCR版) 【MeRIP试剂盒】(A-P-9018)-EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit/艾德科技---m6A RNA甲基化片段富集试剂盒(qPCR版) 【MeRIP试剂盒】(A-P-9018)-EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment Kit//