为了推动mRNA m5C修饰研究,表观生物新推出单碱基分辨率的mRNA m5C BS-seq技术服务。该技术使用重亚硫酸盐对不含修饰的C进行处理,使其在PCR之后转换为T,而m5C修饰并不能进行该转换。结合体外合成全转录组无修饰RNA技术,在mRNA m5C BS-seq中加入IVT RNA作为负对照,得到高置信度的m5C位点,降低了检测结果中的假阳性...
45 -- 12:10 App Ribo-seq与mRNA-seq联合分析报告解读 31 -- 3:45 App 一个视频讲清ATAC-seq技术原理、操作流程、产品优势等内容! 774 -- 8:26 App 5.KEGG、GO富集分析 33 -- 2:02 App 绝对定量转录组测序 UMI RNA-seq保姆级介绍 31 -- 3:55 App CUT&Tag测序技术全方位介绍 997 -- 46...
为进一步探索NSUN2介导的基因表达调控,作者对NSUN2敲除的卵巢癌细胞进行RNA测序(RNA-seq),并对卵巢癌细胞进行RNA结合蛋白免疫沉淀测序(RIP-seq)。测序分析结果表明,在卵巢癌细胞中,NSUN2敲除导致1744个基因表达变化,RIP-seq显示NSUN2能够与2842个转录本结合。GO分析揭示通过RNA-seq和RIP-seq鉴定的转录本被富集在...
MeRIP-Seq (m6A-seq, m1A-seq, m5C-seq, m7G-seq) m6A研究背景 m1A研究背景 m5C研究背景 m7G研究背景 服务特点 实验流程 结果展示 m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰,同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6...
RNA-BS-seq结合高通量测序技术,能够对细胞中的RNA进行整体分析,从而绘制出m5C修饰的全转录组图谱。这使得研究人员能够系统地了解m5C修饰在不同RNA种类(如mRNA、tRNA、rRNA等)中的分布情况。且该技术被应用于多种生物和组织条件,例如人类HeLa细胞和多种小鼠组织,通过这些研究,发现了m5C修饰在不同物种和组织中的保守性...
优势四:**提供m5C一站式服务:m5C整体水平检测、m5C-seq、MeRIP-qPCR验证、RIP和RNA pull-down等。 优势五:率先研发超微量MeRIP测序技术,RNA量低至500ng起。 优势六:提供多种RNA修饰测序服务,包含m6A、m5C、m1A、m7G、m3C、m6Am、O8G、ac4C乙酰化和2'-O-甲基化测序。
m5C bsRNA-seq结题报告解读, 视频播放量 34、弹幕量 0、点赞数 0、投硬币枚数 0、收藏人数 0、转发人数 1, 视频作者 康测科技, 作者简介 ,相关视频:ATAC-seq 讲解,miRNA-seq结题报告解读,ac4c-seq报告解读,BS-seq报告解读视频,Nanopore DRS结题报告解读,CAGE-seq结题
研究通过RNA-Bis-seq等分析鉴定出m5C甲基转移酶NSUN2在CRC中表达水平升高及其在CRC中的致癌作用,以及潜在的遗传和分子机制。NSUN2诱导的代谢重编程以m5C依赖性方式调控ENO1表达增强葡萄糖代谢,导致CRC细胞中乳酸产生增加。此外,乳酸不仅通过组蛋白H3K18乳酸化(H3K18la)激活NSUN2转录,还诱导NSUN2在Lys356残基(K356...
常见的m5C研究⽅法有:MeRIP-seq、miCLIP、Aza-IP、RNA-BS-seq等。其中,RNA-BS-seq是⼀种能够从单碱基分辨率⽔平检测m5C的强有⼒的技术。该技术利⽤重亚硫酸盐处理RNA,使RNA上没有发⽣修饰的C被转化为U,⽽发⽣m5C修饰的C碱基则保持为C。经过PCR,U转变成T,这样便将m5C与C区分开来。结合⾼...
整合RNA-seq和m5C-BS分析结果,表明QSOX1(quiescin sulfhydryl oxidase 1)是m5C异常修饰的潜在靶点。NSUN2甲基化QSOX1编码序列区域,通过m5C readers Y-box结合蛋白1(YBX1)增强QSOX1翻译。NSUN2-YBX1-QSOX1通路的基因沉默克服了非小细胞肺癌中固有的吉非替尼耐药性。本研究揭示了先前未被识别的NSUN2-YBX1-QSO...