点击阅读往期精彩: NGS精进 | py基础 | py绘图 | perl基础 | R绘图 ❝ 本文简单的介绍mRNA,miRNA,lncRNA及circRNA组测序原理、生信常规分析。 ❞转录组测序简介「转录组」(Transcriptome)是组织中单个或一组细…
老实说,lncRNA和circRNA原本同属一宗,只不过circRNA因独特的环状结构以及数量庞大的基数,才独立出来自成一派。显然,lncRNA与circRNA的相关研究是有共通之处。既然circRNA已然跨界领跑蛋白编码,那么lncRNA又岂能屈居人后呢?很快,lncRNA点亮了新技能,以短ORF编码特定多肽,誓要在蛋白编码领域分一杯羹。 至于lncRNA到底能...
那么如若不想与心怡的lncRNA分子失之交臂,就需要先选择NCBI-Gene、Ensembl、NONCODE或LNCipedia这四大数据库之一,对lncRNA的序列大小、染色体定位、其表达的时间/组织特异性等信息进行分析,尽量做到知根知底。 而为了让大家对lncRNA的所有信息一览无遗,解螺旋针对lncRNA数据库使用的痛点,贴心推出单元课07【LncRNA信息...
lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA调控关系如Sankey图(图7H和图7I)。总共5个lncRNA、6个circRNA、8个miRNA和5个mRNA构成了ceRNA网络(图7J)。 5.关键基因在肝细胞癌中的诊断和预后价值 对ceRNA网络中的关键基因进行ROC曲线分析。结果表明,所有mR...
大家都知道,RNA世界有三宝:miRNA、lncRNA和circRNA。无论是其中哪一个,均有众多的科研者对其进行孜孜不断的探索与追求。老实说,这世上原本没有套路,只不过做的人多了,套路也就应运而生了。而lncRNA红火了这么些年,套路也是层出不穷,但其中最为经典的也无外乎以下几种套路。
miRNA、LncRNA、CircRNA互相作用 LncRNA vs. miRNA 什么是lncRNA和miRNA,他们都来自一个大家庭:非编码RNA(non-coding RNA)。 先说微小RNA(micro RNA, miRNA),MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单...
1、特异性高,可针对lncRNA不同序列设计ASO序列 2、经化学修饰,稳定性高 3、可直接用于体内实验,无需转染试剂 4、相对病毒载体,合成周期短,适于后续核酸药研发 哪种lncRNA/circRNA/基因沉默产品适合您? 锐博生物提供全面的siRNA、Smart Silencer、ASO等多种高效的lncRNA/circRNA/基因抑制工具,请根据下表选择适合您...
- circRNA是一种形成环状结构的RNA，具有较强的稳定性。- 研究方法包括circRNA测序、RNase R消化实验、...
lncRNA研究利器之"TANRIC":一个探索癌症中 lncRNA功能的交互式开放平台 lncRNA常用的研究策略,你造吗? circRNA 1、背景介绍 环状RNA(Circular RNA,circRNA)是一类具有闭合环状结构的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),主要由前体RNA(pr...
对于 circRNA,其作用机制主要与 lncRNA 相似,但由于其环状结构的特点,它们通常更加稳定,不易被降解。circRNA 也可以通过类似的方式作为 miRNA 海绵,调控基因转录,并且在某些情况下,它们可能通过特定的回转录(back-splicing)事件产生,进而影响相关基因的表达。综上所述,lncRNA 和 circRNA 通过这些复杂的作用机制参与了...