❝ 本文简单的介绍mRNA,miRNA,lncRNA及circRNA组测序原理、生信常规分析。 ❞ 转录组测序简介 「转录组」(Transcriptome)是组织中单个或一组细胞某个状态下DNA转录出的所有RNA集合,所有RNA可分为「编码RNA」(mRNA)和「非编码RNA」(miRNA , piRNA, SiRNA, SnRNA,lncRNA, NAT, eRNA, circ RNA, ceRNAs等等)...
此外,lncRNA也可调节特定通路和/或生物过程中的基因表达。 04、觉醒新技能,编码小分子多肽 老实说,lncRNA和circRNA原本同属一宗,只不过circRNA因独特的环状结构以及数量庞大的基数,才独立出来自成一派。显然,lncRNA与circRNA的相关研究是有共通之处。既然circRNA已然跨界领跑蛋白编码,那么lncRNA又岂能屈居人后呢?很快...
对于 circRNA,其作用机制主要与 lncRNA 相似,但由于其环状结构的特点,它们通常更加稳定,不易被降解。circRNA 也可以通过类似的方式作为 miRNA 海绵,调控基因转录,并且在某些情况下,它们可能通过特定的回转录(back-splicing)事件产生,进而影响相关基因的表达。综上所述,lncRNA 和 circRNA 通过这些复杂的作用机制参与了...
RNA缩略词详解lncRNA：长链非编码RNA（long non-coding RNA）miRNA：微小RNA（microRNA）circRNA：环状RNA（circular RNA）ncRNA：非编码RNA（non-coding RNA）tRNA：转运RNA（Transfer RNA）rRNA：核糖体RNA（ribosomal RNA）snRNA：小核RNA（small nuclear RNA）snoRNA：小核仁RNA（small nucleolar RNA）sncRNA：小分子...
大家都知道,RNA世界有三宝:miRNA、lncRNA和circRNA。无论是其中哪一个,均有众多的科研者对其进行孜孜不断的探索与追求。老实说,这世上原本没有套路,只不过做的人多了,套路也就应运而生了。而lncRNA红火了这么些年,套路也是层出不穷,但其中最为经典的也无外乎以下几种套路。
肝细胞癌(HCC)占肝癌的大部分,其发病率和死亡率逐年上升。尽管临床管理有所改善,但由于其高复发率和短生存期,仍然存在巨大挑战。CeRNA是一类能够竞争性地结合共享miRNA并在转录后水平上相互交叉调节的ncRNA。在细胞质中,lncRNA和circRNA可以...
LncRNA作为RNA三宝(miRNA、lncRNA和circRNA)之一,是一类长度超过200nt的非编码RNA分子,其缺乏开放阅读框(ORF),无编码蛋白质功能,迄今为止,国内外学者依然热衷于lncRNA的生物学功能研究。近5年来,lncRNA相关文章发表量直线上升,并依然可作为RNA功能研究的主力军。
本文总结了驱动circRNA和lncRNA翻译的机制并通过识别它们的翻译产物,验证其在生理学和癌症中发挥的功能。 真核基因组大约90%的基因组被转录,但是实际上只有1-2%转录基因实际编码蛋白质,非编码RNA (ncRNA),如microRNA(miRNA),长链非编码RNA(lncRNA), 环状RNA(circRNA)和小核仁RNA(snoRNA)无需翻译为蛋白质但可以...
miRNA, lncRNA, circRNA都是RNA,它们的区别在于miRNA是微小RNA,长度较短,约20~25个核苷酸;lncRNA是长链非编码RNA,长度较长,长度一般大于200核苷酸,circRNA是环状RNA,一般呈环状存在。 对于miRNA和lncRNA来说,它们的长度不同决定了针对它们研究的难易程度不同。另外,现有的针对三种RNA的研究程度不同,这决定了在具体...
circRNA vs. miRNA 简略circRNA的研究过程 1993,Cocquerelle等人在人类细胞的 ets-1 locus中发现了两个非聚腺苷酸化的环形亚型。同年,Capel等人发现了一个来自于Sry locus的circRNA。 随后测序技术及生物信息学的发展,证实circRNA是一类由pre-mRNAs反向剪切形成且大量存在的...