结果表明,所有mRNA、lncRNA、circRNA和6个miRNA(hsa-miR-10a-5p、hsa-miR-150-5p、hsa-miR-214-5p、hsa-miR-23b-3p、hsa-miR-26a-5p和hsa- miR-486-5p)均具有良好的诊断价值(AUC>0.7,p < 0.05)(图8A-D)。Kaplan-Meier生存分...
MicroRNAs(miRNAs)是在真核生物中发现的一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,其大小长约20~25个核苷酸。通过碱基互补配对的方式识别靶mRNA,并降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻译。而LncRNA(Long non-coding RNA, lncRNA),即长链非编码RNA,具有miRNA海绵的作用,可特异性吸附大量miRNA。与mRNA竞争性结合miRNA,从而在生命...
通过网络数据库miR CODE、LNCBase等预测LncRNA-miRNA-mRNA轴上相关的靶基因。确定靶基因后，通过miRNA的种子序列或自由能结合方式进行miRNA与LncRNA可能结合位点的预测，并通过双荧光素酶实验进行验证。本期内容针对LncRNA的简介分类、功能、常用数据库、研究思路及功能调控等四大方面进行了详细介绍，希望对LncRNA研究方向...
然而，后来发现，虽然一些miRNA是由premRNAs8的内含子生成的，但是miRNA和snoRNAs的非编码初级转录本也可...
microRNA(miRNA):长度22nt左右,是内源性非编码小RNA。其实除了mRNA,基本上其它RNA都是非编码RNA,不能决定蛋白的氨基酸序列。miRNA的功能主要是调控RNA的转录,通过结合mRNA导致基因沉默,即可以导致靶基因表达下调。 lncRNA:长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA,在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调...
外泌体是星形胶质细胞释放的一种细胞外囊泡,是星形胶质细胞、小胶质细胞和神经细胞之间的信号传递体。其包含丰富的lncRNA、circRNA和miRNA,然而,目前关于心脏骤停时星形胶质细胞-小胶质细胞串扰的外泌体研究仍很少。lncRNA/miRNA/mRNA轴在心脏骤停/心肺复苏中的确切作用尚未完全阐明。
通过网络数据库miR CODE、LNCBase等预测LncRNA-miRNA-mRNA轴上相关的靶基因。确定靶基因后,通过miRNA的种子序列或自由能结合方式进行miRNA与LncRNA可能结合位点的预测,并通过双荧光素酶实验进行验证。 本期内容针对LncRNA的简介分类、功能、常用数据库、研究思路及功能调控等四大方面进行了详细介绍,希望对LncRNA研究方向...
小拓展1:RBP分子并不像miRNA或是EZH2一样,仅对下游mRNA或基因产生抑制。在上文分享的例子中,PTBP1是降解靶基因的mRNA的,但是也有文献报道PTBP1能够增加某些mRNA的稳定性(Long noncoding RNA ANCR inhibits the differentiation of mesenchymal stem cells toward definitive endoderm by facilitating the association of...
使用microT、miRmap和TargetScan预测miRNA的潜在靶基因。 验证GCSC中miRNA的过表达。 检测miRNA过表达的GCSC中靶基因表达水平。 通过双荧光素酶报告基因测定验证miRNA与靶基因的互作。 GCSCs和GCNSCs中miRNA靶基因的表达水平。 GCSC和GCNSC中miRNA靶基因的Western Blot。
❝ 本文简单的介绍mRNA,miRNA,lncRNA及circRNA组测序原理、生信常规分析。 ❞ 转录组测序简介 「转录组」(Transcriptome)是组织中单个或一组细胞某个状态下DNA转录出的所有RNA集合,所有RNA可分为「编码RNA」(mRNA)和「非编码RNA」(miRNA , piRNA, SiRNA, SnRNA,lncRNA, NAT, eRNA, circ RNA, ceRNAs等等)...