应用技术:LCM、RNA-seq 研究结论:通过LCM和RNA-seq技术鉴定出四种癌细胞亚型(C1-C4)和三种癌旁间质亚型(S1-S3),这些间质特异性亚型与DFS相关。选取13个基因进行预后分类,并通过573名患者的独立验证集和开发的RNA-ISH方法验证了其预后评估价值。 一、研究背景 胰腺导管腺癌(PDAC)是人类最致命的癌症之一,与PDAC相...
空间转录组(Spatial Transcriptomics)用以研究不同空间位置特定细胞类型的表达谱,基于激光显微切割(LCM)的空间转录组技术LCM-RNAseq鉴于LCM的单细胞分辨率,在切割目标组织中细胞的同时,可以获得组织中细胞的空间位置信息,结合转录组测序,可用于空间转录组研究。
空间转录组(Spatial Transcriptomics)用以研究不同空间位置特定细胞类型的表达谱,基于激光显微切割(LCM)的空间转录组技术LCM-RNAseq鉴于LCM的单细胞分辨率,在切割目标组织中细胞的同时,可以获得组织中细胞的空间位置信息,结合转录组测序,可用于空间转录组研究。
空间转录组(Spatial Transcriptomics)用以研究不同空间位置特定细胞类型的表达谱,基于激光显微切割(LCM)的空间转录组技术LCM-RNAseq鉴于LCM的单细胞分辨率,在切割目标组织中细胞的同时,可以获得组织中细胞的空间位置信息,结合转录组测序,可用于空间转录组研究。
2.LCMC3研究的思路很明确,做最大人群的II期单臂临床,搞最广的单药新辅助免疫临床数据。老三步总结下来可以说是:临床有效性安全性分析+外周血免疫细胞与疗效评价+原发灶bulk RNA-Seq测序+TMB+单细胞。 可以回顾一下既往的Neostar研究,对比一下在新辅...
Research-use reagents and kits for the complete LCM workflow—from identifying and selecting cells to isolating and purifying RNA and DNA. LCM slides & accessories A suite of slides and accessories to enable research on live cells using your Arcturus LCM System. Laser capture microd...
最近,来自德国EMBL-EBI的单细胞大牛Andreas Trumpp和Simon Haas等人在BioRxiv预印本上发表了结合scRNAseq和LCM-seq来分析骨髓的内环境的最新研究成果: 一、研究人员首先通过scRNAseq分析骨髓中存在的不同细胞类群 1.实验设计: 2. 使用Seurat包进行分析,值得学习的地方是如何确定细胞类群: 3. 确定了骨髓中存在的32个...
Research-use reagents and kits for the complete LCM workflow—from identifying and selecting cells to isolating and purifying RNA and DNA. LCM slides & accessories A suite of slides and accessories to enable research on live cells using your Arcturus LCM System. Laser capture microdissection applicat...
Bulk RNA-seqhttps://www.youtube.com/watch?v=UgslMZ74ums Cellar heterogeneity细胞异质性的原因是morphology&genome&transcription&proteome,Cellar heterogeneity细胞异质性导致tumor。对于tumor使用PD1/PDL1无效,现在依据个性化需要使用single cell analysis,人群队列。
2.LCMC3研究的思路很明确,做最大人群的II期单臂临床,搞最广的单药新辅助免疫临床数据。老三步总结下来可以说是:临床有效性安全性分析+外周血免疫细胞与疗效评价+原发灶bulk RNA-Seq测序+TMB+单细胞。 可以回顾一下既往的Neostar研究,对比一下在新辅助...