一个in文件中可以有多个dump命令,但是dump命令的id不能重复。具体可输出的量可查阅手册的描述。常用的命令形式为 dump myDump all atom 100 dump.atom 第二十六条命令compute。compute是LAMMPS中极其重要的一类命令。当你需要计算某个量时你就可以考虑使用compute命令。LAMMPS提供了丰富的compute命令,具体使用时,根据你...
thermo_style有三种主要的显示方式:one、multi、custom。 thermo_style one命令是把信息都输出在一行中,这也是thermo_style默认的方式,如果不写thermo_style命令,系统默认的就是thermo_style one。 因此,下面2个命令是等价的: #输出设置1thermo100#输出设置2thermo100thermo_styleone thermo_style multi命令使用多行显...
1 thermo命令 lammps提供了thermo命令实时把模拟结果信息输出到屏幕上,同时也会把信息存入到log文件,便于后期数据处理。 thermo命令语法格式: thermo N 1. N表示每隔N步在屏幕上输出默认信息。 2.thermo_style命令 通常,thermo命令配合thermo_style使用。 thermo_style可以设置哪些信息会被显示到屏幕上,命令格式为: th...
例如,每100步在屏幕上输出步数(step)、稳定(temp)、压力(press)、势能(pe)、体积(vol),三个方向尺寸(lx ly lz)可以写为: thermo 100 thermo_style custom step temp press pe vol lx ly lz 1. 2. 显示结果如下: thermo命令不仅把数据显示到屏幕上,同时把显示数据保存到log.lammps中,便于后期进行数据处理。
thermo命令输出的值保存到log.lammps文件中,模拟完成后需要从这个文件中把需要的数据复制出来再进行绘图处理。 用的比较多的是thermo_style custom: thermo 50 #每隔50步输出数据 thermo_style custom step temp vol lx ly lz press epair evdwl ecoul elong ebond eangle pe ke etotal v_zLength ...
穿这个讨论,用户要注意他们可以添加自己的compute命令和fix命令,通过这些命令定义自己的输出。 Thermodynamic output 热力学输出的频率和格式是由thermo、thermo_style、thermo_modify命令设置 的。thermo_style命令也指定了哪些数值需要被计算输出。可以指定预先定义的变量(例如press、etotal等等)。还可以指定三类 ...
这个命令将输出每个时间步长的原子组间作用力。其中,"thermo_style"是输出格式的设置,"custom"表示自定义输出格式,"step"表示输出时间步长,"c_myforce[1]"、"c_myforce[2]"和"c_myforce[3]"分别表示输出x、y和z方向上的原子组间作用力。 最后,我们需要在LAMMPS输入文件中添加以下命令: ``` run 1000 ```...
Thermo_style命令主要是用来说明采样的内容,即输出到屏幕或者| 文件事的内容。 (/doc/thermo_style.htmiJ ! Thermo_style style argsi一I . . , Style=ona multi、customjArgs&qu 7、ot;特定的参数列表iOne args=nonei!Multi args=noneI!Custom args=list of attributesI1 Ij Possible attributes=step elao...
总结: 在LAMMPS中,我们可以使用pair_style命令定义分子力场,使用group命令定义分子组,使用compute命令定义计算范德华和静电相互作用力,并使用variable和thermo_style命令输出力的数值。通过按照上述步骤,我们可以很容易地单独统计两个组之间的范德华相互作用力和静电相互作用力。©...
在LAMMPS中,有两种类型的compute命令:一种计算global value(例如温度,压强张量)另一种计算per-atomvalues。只有前者可以作为热力学输出。用户指定的compute命令的ID加上一个可选的下标作为thermo_style命令的一部分。例如c_myTemp 输出由该compute得到的标量值;c_myTemp[2]输出第2个矢量分量。注意compute reduce可以对...