48 v_name = value calculated by an equal-style variable with name(由具有名称的等式变量计算的值) 49 v_name[I] = value calculated by a vector-style variable with name(由具有名称的矢量样式变量计算的值)
此命令用来设置输出的热力学数据内容;最常用的是 custom style 允许自定义设置需要输出的热力学量 (list列表中的都可以),其中c_ID, f_ID, v_name是通过compute, fix,variable (equal-style)定义的计算量;输出的热力学量值都是瞬时值,也就是说每步会输出,要想用之间时间步的值作平均的话,需要用fix ave/time...
thermo_style custom命令格式为: thermo_style custom 输出量1 输出量2 输出量3 …… 1. 能够在thermo_style custom命令中输出的量不仅包含系统已经定义好的变量,还包括通过compute、fix、variable等命令生成的自定义变量。 主要有: step, elapsed, elaplong, dt, time, cpu, tpcpu, spcpu, cpuremain, part,...
全局量可以使用命令thermo_style custom or fix ave/time 输出,也可以以equal类型或atom类型的变量进行引用。 单原子量可以使用 dump customor fix ave/spatial命令进行输出,也可以使用 fix ave/atom命令对时间进行平均,或使用compute reduce 命令进行降维,或使用atom-style类型的变量进行引用。 局域量可以使用compute ...
的。thermo_style命令也指定了哪些数值需要被计算输出。可以指定预先定义的变量(例如press、etotal等等)。还可以指定三类 keyword(c_ID、f_ID、v_name),分别由compute、fix、variable命令提供相应的数据。以下依次讲述。 在LAMMPS中,有两种类型的compute命令:一种计算global value(例如温度,压强张量)另一种计算per-atom...
fix ave/time命令能够对任何全局量进行时间平均,例如那些输出的热力学信息。由用户指定一个或多个需要进行时间平均的物理量,可以是 compute命令得到的全局量、fix命令得到的全局量,或者非atom-style变量。因为变量可以涉及thermo_style custom 命令使用的keyword(例如temp或press),那么任何热力学量都可以按这种方法进行时...
总结: 在LAMMPS中,我们可以使用pair_style命令定义分子力场,使用group命令定义分子组,使用compute命令定义计算范德华和静电相互作用力,并使用variable和thermo_style命令输出力的数值。通过按照上述步骤,我们可以很容易地单独统计两个组之间的范德华相互作用力和静电相互作用力。©...
timestep, run_style, min_style, min_modify等。模拟过程 中通过compute, compute_modify, variable等一些命令来 制定。而输出选项可以由thermo, dump, restart等一些 命令来设置。 4. Run a simulation 通常run命令被设置在in文件的最后,使用run命
compute, *** !定义计算,一般我们需要的输出数据就需要这个命令来定义 uncompute * 取消某个compute设置 variable**这个命令可以多次使用,定义一个变量 reset_timestep, ** 步长计数器清零,有多个run命令的需注意这个 run_style, 配套run的,不一定需要
我觉得fix命令是lammps中很重要的一个命令,它包括很多子命令,可以施加一系列的边界条件、时间积分、诊断选项等等. 模拟过程中通过下面的命令制定lammps进行各种计算:compute,compute_modify,variable. 输出选项由thermo,dump,restart命令设置. (4)Runasimulation ...