lattice在lammps以两种方式被应用,第一种是利用create_atoms命令在模拟框的晶格格点上创建原子,create_atom命令是给晶格格点上的基原子分配不同的原子类型;第二种是被create_box、region、velocity等命令用作距离单位。 lattice命令需要与模拟维度保持一致,style sc or bcc or fcc or hcp or diamond被用作3D问题,而...
thermo_style有三种主要的显示方式:one、multi、custom。 thermo_style one命令是把信息都输出在一行中,这也是thermo_style默认的方式,如果不写thermo_style命令,系统默认的就是thermo_style one。 因此,下面2个命令是等价的: #输出设置1thermo100#输出设置2thermo100thermo_styleone thermo_style multi命令使用多行显...
1. thermo命令 lammps提供了thermo命令实时把模拟结果信息输出到屏幕上,同时也会把信息存入到log文件,便于后期数据处理。 thermo命令语法格式: thermo N 1. N表示每隔N步在屏幕上输出默认信息。 thermo 50运行结果如下: 2. thermo_style命令 通常,thermo命令配合thermo_style使用。 thermo_style可以设...
例如,每100步在屏幕上输出步数(step)、稳定(temp)、压力(press)、势能(pe)、体积(vol),三个方向尺寸(lx ly lz)可以写为: thermo 100 thermo_style custom step temp press pe vol lx ly lz 1. 2. 显示结果如下: thermo命令不仅把数据显示到屏幕上,同时把显示数据保存到log.lammps中,便于后期进行数据处理。
Thermo 命令用于定义每隔一定时间步长输出一次采样内容。 Thermo N 每隔N 个时间步长输出一次采样内容至屏幕或者 log 文件 Thermo_style: Thermo_style 命令主要是用来说明采样的内容,即输出到屏幕或者 LOG 文件中的内容。(http://lammps.sandia.gov/doc/thermo_style.html) ...
thermo命令输出的值保存到log.lammps文件中,模拟完成后需要从这个文件中把需要的数据复制出来再进行绘图处理。 用的比较多的是thermo_style custom: thermo 50 #每隔50步输出数据 thermo_style custom step temp vol lx ly lz press epair evdwl ecoul elong ebond eangle pe ke etotal v_zLength ...
穿这个讨论,用户要注意他们可以添加自己的compute命令和fix命令,通过这些命令定义自己的输出。 Thermodynamic output 热力学输出的频率和格式是由thermo、thermo_style、thermo_modify命令设置 的。thermo_style命令也指定了哪些数值需要被计算输出。可以指定预先定义的变量(例如press、etotal等等)。还可以指定三类 ...
这个命令将输出每个时间步长的原子组间作用力。其中,"thermo_style"是输出格式的设置,"custom"表示自定义输出格式,"step"表示输出时间步长,"c_myforce[1]"、"c_myforce[2]"和"c_myforce[3]"分别表示输出x、y和z方向上的原子组间作用力。 最后,我们需要在LAMMPS输入文件中添加以下命令: ``` run 1000 ```...
在LAMMPS中,可以使用`thermo`命令来输出各种热力学信息,包括原子的均方位移(MSD) 首先,你需要确保你的LAMMPS输入脚本中包含了`thermo`命令,并且设置了合适的输出频率。例如: 0 thermo_style custom step lx ly lz press pxx pyy pzz pe temp ,你可以找到每一步的原子的位置信息。然后,你可以使用Python或其他语言...
Thermo_style命令主要是用来说明采样的内容,即输出到屏幕或者| 文件事的内容。 (/doc/thermo_style.htmiJ ! Thermo_style style argsi一I . . , Style=ona multi、customjArgs&qu 7、ot;特定的参数列表iOne args=nonei!Multi args=noneI!Custom args=list of attributesI1 Ij Possible attributes=step elao...