LAMMPS中的pair_style,pair_coeff和pair_modify三个命令设置了势函数的类型和参数。neighbor, neigh_modify, comm_style和comm_modify四个命令设置了邻域列表建立和计算单元通讯,会显著影响势函数计算的效率。通常,分子动力学模拟中最耗时的步骤并不是力-加速度-速度-位移的积分运算,而是势函数的计算。因此,本文将详细...
关于lammps中的pair_modify，其中的table tabinner看了手册也不是很明白，请高手指导，另外 shift 和...
不同的力场有不同的pair_style,模拟中要根据对象选择合适的pair_style。LAMMPS集成了目前几乎所有的pair_style。模拟时只需要根据对象进行选择即可。pair_style对于绝大多数模拟都需要定义。不同的pair_style具有不同的语法,具体可查阅手册。pair_style中一般会定义截断半径的大小。以最简单的包含范德华的pair_style为...
不同的力场有不同的pair_style,模拟中要根据对象选择合适的pair_style。LAMMPS集成了目前几乎所有的pair_style。模拟时只需要根据对象进行选择即可。pair_style对于绝大多数模拟都需要定义。不同的pair_style具有不同的语法,具体可查阅手册。pair_style中一般会定义截断半径的大小。以最简单的包含范德华的pair_style为...
pair_style: 相互作用力场类型,例如范德化势或者硬球势等。 bond_style: 键合相互作用势类型。 angle_style: 键角作用势类型。 dihedral_style: 二面角作用势类型。 improper_style: 混合作用势类型。 其他还有一些参数设置,例如newton, processors, boundary, atom_modify等。
力场的设置分两步，首先设置力场类型，如pair_style、bond_style、angle_style、dihedral_style、improper_...
pair_coeff 1 1 9.4389999720 2.3379999999 # Cu 1. data文件中的pair_coeff只需写出同种原子之间的势参数,不同原子之间的势参数会自动计算,具体可参考pair_modify命令。 后面的bond、angle基本类似。 (2) in文件的写法 既然data文件已经自动设置了cvff势,在in文件中只需写明势的类型即可,势的类型就是data中各种...
这个拟合过程由lammps自动完成,不需要人为干预,pair_modify命令可以选择拟合方式。 3. lj/cut参数如何获取? 大多数原子lj/cut参数都可以从文献中查到,如果实在找不到某两种原子之间的lj/cut参数,可以使用上面的公式进行计算。 例如,查文献得到Cr-Cr和Fe-Fe的参数为(epsilon、sigma): ...
#---3 势函数设置---pair_style airebo 3.0 0 0pair_coeff * * CH.airebo C C C#--- 建模完成后对体系进行能量最小化,获得最优结构 #---4 能量最小化---min_style cgminimize 1e-10 1e-10 5000 5000#---
Pair | 0 | 0 | 0 | 0.0 | 0.00Neigh | 0 | 0 | 0 | 0.0 | 0.00Comm | 0 | 0 | 0 | 0.0 | 0.00Output | 0 | 0 | 0 | 0.0 | 0.00Modify | 0 | 0 | 0 | 0.0 | 0.00Other | | 0 | | | 0.00Nlocal: 32000 ave 32000 max 32000 minHistogram: 1 0 0 0 0 0 0 0 0 ...