如果你在定义一个新的fix命令时,所使用的ID和类型名与某个已经定义的fix命令完全相同,那么先前定义的那个fix命令就会被删除掉,而新的fix命令会被创建,所使用的参数也是重新定义的。这样做就好像是在定义这个新的fix命令之前,先使用unfix命令取消了旧fix命令,除了说它们所作用的顺序会因着定义的位置不同而有所差异。
在该fix命令下npt和nph的控制器参数可以使用一个或一个以上,分别为iso,aniso,tri,x,y,z,xy,xz,yz和couple等关键词。 这些关键词可以用来特定控制外部应力张量的六个分量,或者耦合这些分量一起因此他们(应力分量)所代表的尺寸可以在一个恒压模拟中一起变化。 其它相关的关键词pchain,mtk,ploop,nreset,drag, 和...
在该fix命令下npt和nph的控制器参数可以使用一个或一个以上,分别为iso,aniso,tri,x,y,z,xy,xz,yz和couple等关键词。 这些关键词可以用来特定控制外部应力张量的六个分量,或者耦合这些分量一起因此他们(应力分量)所代表的尺寸可以在一个恒压模拟中一起变化。 其它相关的关键词pchain,mtk,ploop,nreset,drag, 和...
在该fix命令下npt和nph的控制器参数可以使用一个或一个以上,分别为iso,aniso,tri,x,y,z,xy,xz,yz和couple等关键词。 这些关键词可以用来特定控制外部应力张量的六个分量,或者耦合这些分量一起因此他们(应力分量)所代表的尺寸可以在一个恒压模拟中一起变化。 其它相关的关键词pchain,mtk,ploop,nreset,drag, 和...
LAMMPS中的系综（NPTNVT）命令 LAMMPS中的系综（ NPTNVT）命令 语法：fix ID group-ID style_name keyword value ...ID 是fix名，group-ID是fix所作⽤的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。 style_name可以选择NVT、NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 keyword = temp or iso or aniso ...
全局量可以使用命令thermo_style custom or fix ave/time 输出,也可以以equal类型或atom类型的变量进行引用。 单原子量可以使用 dump customor fix ave/spatial命令进行输出,也可以使用 fix ave/atom命令对时间进行平均,或使用compute reduce 命令进行降维,或使用atom-style类型的变量进行引用。
比如fix 1 all npt temp 200 500 0.2 x 1.0 1.0 2 y 1.0 1.0 2 z 100 100 2 couple none drag 1.0 前面的我能理解,是设定一个编号为1的npt升温过程,温度从200升温到500,温度阻尼是0.2,但是后面的x,y,z 及couple drag等应当如何理解啊?手册看不太懂。 返回小木虫查看更多分享...
x、y、z、xz、zy方向）的应力为零，从而计算xy方向的剪切模量。控压命令使用的是fix npt命令。
thermo 100 thermo_style custom step press pe temp ke dump 1 all atom 100 mini.lammpstrj # 每100步转储一次原子坐标 fix 1 all npt temp 300 300 1 y 0 0 1 z 0 0 1 drag 1 # 应用NPT系综,设置目标温度为300K,在y和z方向上不控制压力,在x方向上控制压力 run 100000 # 运行100000步模拟 总...
fix 2 all npt 1.0 1.0 1.0 aniso 0.0 0.0 NULL NULL NULL NULL 10.0 drag 1.0 thermo 1000 # 每1000 步输出一次结果 timestep 0.002 # 时间步长 0.002ps run 10000 #运行 10000 步 unfix2 fix 3 all nve fix 4 all temp/rescale 100 1.0 1.0 5 1.0 ...