fix npt命令名称就可以看出,它的主要作用是对体系进行控温和控压操作。 npt的控温原理与nvt类似,通过调整原子的速度来调整整个体系的温度。 体系压力的控制则通过调整box的尺寸进行调节,如果体系压力超过设定压力值,会扩大box尺寸,同理,体系压力小于设定压力值,则会缩小box的尺寸。 至于调节哪个方向的尺寸,可以根据需要...
如果三个方向都需要调节压力,可设置iso或aniso: fix1npttemp3003000.1iso001 fix1npttemp3003000.1ansio001 1. 2. 这两个命令都是调节三个方向的压力,不同点在哪里? iso表示x、y、z三个方向压力耦合到一起,三个方向以相同的比例进行缩放。 aniso表示x、y、z三个方向根据各自方向的压力独立调节尺寸,压力大的方...
npt语法和nvt差不多,只不过多了Pstart Pstop Pdamp三个参数进行压力控制。 Pstart、Pstop分别为初始压力、结束压力,Pdamp压力调节阻尼系数,通常为1000*timestep。 需要注意的是,npt在控压方向上必须保证边界条件为p,否则会出错。 #温度300k,iso表示在各个方向上进行控压,压力为0fix1allnpttemp300.0300.0100.0iso...
在这个示例中,fix 1 all npt temp 300 300 100 iso 0 0 1000命令设置了NPT系综,其中目标温度为300K,温度阻尼系数为100,压力控制模式为各向同性,压力目标值为0,压力阻尼系数为1000。 5. 注意事项和常见错误 在设置NPT系综时,需要注意以下几点: 选择合适的阻尼系数:Tdamp和Pdamp的选择对模拟的稳定性和效率有很大...
fix 1 all npt temp 1.0 1.0 100.0 iso 1.0 1.0 1000.0 run 10000 这个脚本中,首先使用Lennard-Jones势进行原子相互作用的模拟,然后设置NPT模拟的参数,其中温度为1,压力为1,体积为1000,并进行10000步的模拟。 步骤三、运行模拟 将上述脚本储存为文件,例如npt.in,然后运行LAMMPS软件,输入以下命令,即可启动模拟: ...
一、NPT控压方法 NPT(isothermal-isobaric ensemble)方法是一种通过控制体系的温度和压力来模拟恒定温度和压力的方法。在LAMMPS中,可以通过以下命令启用“KSPACE”软件包:`make yes-kim`。然后,在输入脚本中使用如下命令来实现NPT控制:`fix npt all npt temp T_start T_end T_damp iso ...
在退火的时候，当模型运行到fix 3 all npt temp 498.15 498.15 100 iso 1.0 1.0 1000这一行时...
LAMMPS中的系综（NPTNVT）命令 LAMMPS中的系综（ NPTNVT）命令 语法：fix ID group-ID style_name keyword value ...ID 是fix名，group-ID是fix所作⽤的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。 style_name可以选择NVT、NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 keyword = temp or iso or aniso ...
ID 是fix名,group-ID是fix所作用的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。 style_name可以选择NVT、NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 keyword= temp or iso or aniso or tri or x or y or z or xy or yz or xz or couple
需要注意的是,npt在控压方向上必须保证边界条件为p,否则会出错。 AI检测代码解析 #温度300k,iso表示在各个方向上进行控压,压力为0 fix1allnpttemp300.0300.0100.0iso0.00.01000.0 #温度300k,对x、y方向进行控压,z方向不控压 fix1allnpttemp300.0300.0100.0x0.00.01000y0.00.01000 ...