fix 1 all nvt temp 300.0 300.0 100.0 fix 1 water npt temp 300.0 300.0 100.0 iso 0.0 0.0 1000.0 fix 2 jello npt temp 300.0 300.0 100.0 tri 5.0 5.0 1000.0 fix 2 ice nph x 1.0 1.0 0.5 y 2.0 2.0 0.5 z 3.0 3.0 0.5 yz 0.1 0.1 0.5 xz 0.2 0.2 0.5 xy 0.3 0.3 0.5 nreset 1000 详细...
如果你在定义一个新的fix命令时,所使用的ID和类型名与某个已经定义的fix命令完全相同,那么先前定义的那个fix命令就会被删除掉,而新的fix命令会被创建,所使用的参数也是重新定义的。这样做就好像是在定义这个新的fix命令之前,先使用unfix命令取消了旧fix命令,除了说它们所作用的顺序会因着定义的位置不同而有所差异。
fix 1 all nvt temp 300.0 300.0 100.0 fix 1 water npt temp 300.0 300.0 100.0 iso 0.0 0.0 1000.0 fix 2 jello npt temp 300.0 300.0 100.0 tri 5.0 5.0 1000.0 fix 2 ice nph x 1.0 1.0 0.5 y 2.0 2.0 0.5 z 3.0 3.0 0.5 yz 0.1 0.1 0.5 xz 0.2 0.2 0.5 xy 0.3 0.3 0.5 nreset 1000 详细...
fix 1 all nvt temp 300.0 300.0 100.0 fix 1 water npt temp 300.0 300.0 100.0 iso 0.0 0.0 1000.0 fix 2 jello npt temp 300.0 300.0 100.0 tri 5.0 5.0 1000.0 fix 2 ice nph x 1.0 1.0 0.5 y 2.0 2.0 0.5 z 3.0 3.0 0.5 yz 0.1 0.1 0.5 xz 0.2 0.2 0.5 xy 0.3 0.3 0.5 nreset 1000 1....
LAMMPS中的系综（ NPTNVT）命令 语法：fix ID group-ID style_name keyword value ...ID 是fix名，group-ID是fix所作⽤的群组名。这两个是所有fix命令都需要的。 style_name可以选择NVT、NPT或者NPH 关键词keyword和对应的数值value可以添加 keyword = temp or iso or aniso or tri or x or y or z or...
查阅了大量的资料,总算搞明白,Parrinello-Rahman方程已经整合到fix npt中,在in文件中设置相应的参数即可。 具体步骤如下: (1)设置模拟盒子为prism类型,运行盒子能够在6个方向自由变形。 (2)设置fix npt 参数类型为tri类型。 下面给出NiTi相变P_R控压案例代码: ...
x、y、z、xz、zy方向）的应力为零，从而计算xy方向的剪切模量。控压命令使用的是fix npt命令。
各位大佬,lammps运行出现这种情况是怎么回事fix1allnpttemp0.010.011.00xyz0.00.01.0drag0.2ERROR:Illegalfixnvt/npt/nphcommand(../fix_nh.cpp:365)Lastcommand:fix1allnpttemp0.010.011.00xyz0.00.01.0drag0.2之前没有temp,出现同样的错误,加上之后还是这样,怎么破呢
保持温度不的方法是让系统与虚拟的 热浴处于热平衡npt:等温等压系综,原子数,压强,温度保持不变。温度的恒定与nvt一样,压强的恒 定通过调整体积来实现fix 1 all nvefix 2 all nvt temp 100 300 0.2 drag 1.0fix 3 all npt temp 300 100 0.2 iso 1.0 1.0 2 drag 1.0fix 4 all npt temp 300 100 0 ...
汇报内容 一、分子动力学的简要介绍二、Lammps软件的基本介绍三、Lammps模拟的相关命令四、VMD可视化处理软件的基础使用 一、分子动力学模拟 计算物理可分为两大类：计算求解和计算机模拟 第一原理计算：解薛定谔方程的过程 电子结构方法：H(r)E(r)方程中包含了所有的原子核及电子的哈密度量和波函数 密度...