这个命令比较简单,在element后面按照data文件中mass列表中的顺序指定对应的元素即可: dump 1 all xyz 1dump.xyz - Domain Name For Sale | Dan.com dump_modify 1 element O H Na Cl 在ovito中打开dump.xyz,显示效果比之前要好很多: 需要注意的是,dump_modify element支持的文件格式有限,如果用ovito查看结果,...
这六个参数分别指定全局起点、全局终点、全局间隔、局部起点、局部终点和局部间隔。 dump 1 ... variable tDump equal stride2(500,2000,500,1600,1900,100) dump_modify 1 every v_tDump quit 使LAMMPS退出进程。可以在debug中用于LAMMPS检测到某些状况时中止。 quit status status是可选的,可以是任意数值。一般...
使用的命令为dump_modify element. 这个命令比较简单,在element后面按照data文件中mass列表中的顺序指定对应的元素即可: dump 1 all xyz 1 dump.xyz dump_modify 1 element O H Na Cl 1. 2. 在ovito中打开dump.xyz,显示效果比之前要好很多: 需要注意的是,dump_modify element支持的文件格式有限,如果用ovito查...
lammps教程:dump_modify使模拟图像更美观 以上4种命令是lammps模拟中常见的输出命令,灵活使用这几种命令足以满足模拟需求 日常使用: dump 1 all custom ${interval} ${filename1}.lammpstrj id type x y z #可看看平衡的轨迹
dump文件输出由dump命令和dump_modify命令指定。有很多预先定义的格式,如dump atom、dump xtc等等。同样,有一种 用户指定输出各个原子的哪些属性的dump custom格式。可以指定预定义的keyword(如tag、x、fx)也可以指定另外三种 keyword(即c_ID、f_ID、v_name,分别由compute、fix、variable命令提供相应数值)。以下依次...
3.单原子数据。相关命令主要有dump, dump_modify,undump.时刻牢记这些命令用于处理atom的数据对于你出现的错误就有敏感 性了,呵呵。 4。echo,print,fix print结合variable可以用于调试你的脚本,纠错。 5.秀个例子,用于输出setforce, group原子于其他相互作用力 ...
timestep, run_style, min_style, min_modify等。模拟过程 中通过compute, compute_modify, variable等一些命令来 制定。而输出选项可以由thermo, dump, restart等一些 命令来设置。 4. Run a simulation 通常run命令被设置在in文件的最后,使用run命
Dump file output dump文件输出由dump命令和dump_modify命令指定。有很多预先定义的格式,如dump atom、dump xtc等等。同样,有一种 用户指定输出各个原子的哪些属性的dump custom格式。可以指定预定义的keyword(如tag、x、fx)也可以指定另外三种keyword(即c_ID、f_ID、v_name,分别由compute、fix、variable命令提供相应...
Dump file output dump文件输出由dump命令和dump_modify命令指定。有很多预先定义的格式,如dump atom、dump xtc等等。同样,有一种 用户指定输出各个原子的哪些属性的dump custom格式。可以指定预定义的keyword(如tag、x、fx)也可以指定另外三种keyword(即c_ID、f_ID、v_name,分别由compute、fix、variable命令提供相应...
双引号里面代表是字符串,比如说第一个%8d的意思是dump命令输出的第一个整数型变量占八格,右对齐。然后之后有一个空格,输出第二个整数型变量,占五格。 %25.18g 是指这个输出的浮点数变量占25位,其中有18位是小数部分。 具体的你可以参照这个网页 http://www.cplusplus.com/reference/cstdio/printf/ 赞一下(1...