group C1_atom dynamic addatoms region C1_re every 10 #fix_modify 1 dynamic full thermo_style custom step atoms temp epair etotal press thermo 100 thermo_modify temp add #dump 1 all atom 50 dump/dump.deposit.atom dump 1 all custom 100 dump/deposit.* id type x y z vx vy vz dump 2...
首先准备好LAMMPS输入脚本: dimension3atom_style hybrid bond sph units si boundary p p p variable R equal 0.025 variable L equal 0.6 region simulation_boxcylinderz00$R0$Lside in create_box1simulation_box mass10.03 dump my_dump all atom1prel.dump 然后开始写Python脚本: fromlammpsimportlammpsimport...
atom_style atomic atom_style bond atom_style full atom_style body nparticle 2 10 atom_style hybrid charge bond atom_style hybrid charge body nparticle 2 5 使用介绍 定义模拟过程中原子的类型,它会决定原子包括哪些属性。该命令必须在建立模拟盒子(使用命令read_data或read_restart或create_box)之前使用...
atom_style atomic atom_style bond atom_style full atom_style body nparticle 2 10 atom_style hybrid charge bond atom_style hybrid charge body nparticle 2 5 atom_style spin atom_style template myMols atom_style hybrid template twomols charge atom_style tdpd 2 7.pair_style命令—设置势类型。...
atom_style atomic region box block 0 80 0 10 0 40 units box create_box 2 box region cu block INF INF INF INF INF 20 units box lattice fcc 3.61 create_atoms 1 region cu region al block INF INF INF INF 21 INF units box lattice fcc 4.05 ...
pair_style hybrid lj/cut 8.5 lj/cut 8.5 airebo 3.0 0 1 airebo 3.0 0 1 pair_coeff...
2.shell mkdir output./output/fraction./output/equil3.units metal4.atom_style atomic5.dimension36.boundary p p s7.#建模8.lattice fcc3.61#Cu9.region zbox block06001000100units box10.region cubox block0600100050units box11.create_box6zbox12.create_atoms1region cubox13.settype1type/ratio20.2123465#...
1.定义粒子类型:在输入文件中使用“atom_style”命令定义粒子的类型,例如: atom_style hybrid sphere disk 2.定义粒子属性:使用“atom_type”命令定义每个粒子类型的物理、化学属性,例如: atom_type 1 sphere atom_type 2 disk 3.定义粒子数量:使用“create_atoms”命令创建不同类型的粒子,并指定每种类型的数量,...
16. hybrid混合势设置错误,确保所有pair coeffs设置正确。17. reaxff混合势与fix qeq冲突,根据实际情况应用fix qeq或取消电荷平衡。18. 使用nve系综时温度爆炸,可能由模型不稳定引起,优化模型或检查势函数参数。19. 多个fix命令使用相同compute命令,需要重新配置或调整参数。20. 变量调用错误,确保所有...
使用语法 atom_stylestyleargs 其中: style可取: angleoratomicorbodyorbondorchargeordipoleorelectronorellipsoidorfullorlin eormesoormolecularorperiorsphereortriorhybrid 只有body和hybrid需要设置args(具体参考原文档)使用举例 atom_styleatomic atom_stylebond atom_stylefull atom_stylebodynparticle210 atom_style...