在lammps模拟中,不同的模拟体系对原子类型有一定的要求,最常用的原子类型是atomic、charge、full类型。 聚合物原子有键连接,对应full类型,如果采用反应势(reaxff),对应原子类型为charge类型,对于金属体系,相对比较简单,仅需要原子坐标即可,对应atomic类型。 不同atom_style对应的data文件格式不同,下面分别介绍这三种原子...
1. 设置原子类型为charge atom_style charge 2. 设置pair_style pair_style reax/c lmp_control 其中,reax/c为反应势类型说明,lmp_control为输出控制文件,如果不需要对输出进行控制,可设置为NULL,如: pair_style reax/c NULL 3. 设置pair_coeff 参数设置和其它力场设置差不多,ffield.reax.cho为力场文件,后面...
1. 设置原子类型为charge atom_stylecharge 1. 2. 设置pair_style pair_stylereax/c lmp_control 1. 其中,reax/c为反应势类型说明,lmp_control为输出控制文件,如果不需要对输出进行控制,可设置为NULL,如: pair_stylereax/cNULL 1. 3. 设置pair_coeff 参数设置和其它力场设置差不多,ffield.reax.cho为力场文...
聚合物原子有键连接,对应full类型,如果采用反应势(reaxff),对应原子类型为charge类型,对于金属体系,相对比较简单,仅需要原子坐标即可,对应atomic类型。 不同atom_style对应的data文件格式不同,下面分别介绍这三种原子类型对应的data文件格式。 1.full类型 full类型的原子类型包含的原子信息如下图所示: full类型对应的原...
atom_modify C charge set type 2 charge 0.5 neighbor 0.3 bin neigh_modify every 5...
软件的入门推荐几个公众号:LAMMPS加油站、LAMMPS助手、LAMMPS爱好者,里面都有不错的例程。对于代码的细节问题,强烈建议仔细研读LAMMPS-Manual,里面虽然有极少数的错误(举个例子,atom_style是charge的data文件编写部分),但是所有问题都可以通过它解决。个人经验是用PDF阅读器在每个指令加书签,方便多次查阅。
•lammps的输入文件一般分为4个部分Initialization,Atomdefinition,Settings,Runasimulation，后面的两个部分可以按照需要多次重复；(1)Initialization •在你的模拟体系定义之前,一些参数必须要被设臵.相关的命令有:units,dimension,newton,processors,boundary,atom_style,atom_modify。其中，units:选择单位系统,lammps提供...
lammps atom_style翻译 使用语法 atom_style style args 其中：▪style可取：angle or atomic or body or bond or charge or dipole or electron or ellipsoid or fullor line or meso or molecular or peri or sphere or tri or hybrid ...
1.离子晶体在lammps中atom_style该选择哪一个？仅包含bonds, angles, dihedrals, impropers还有charge嘛...
Note that charges are not included in this example, so there are no Coulomb interactions in this simulation You would need to add charges to the atom types in the '' file to enable these interactions pair_style eam pair_coeff水.eam coulomb Velocity initialization (optional) If you want to...