在lammps模拟中,不同的模拟体系对原子类型有一定的要求,最常用的原子类型是atomic、charge、full类型。 聚合物原子有键连接,对应full类型,如果采用反应势(reaxff),对应原子类型为charge类型,对于金属体系,相对比较简单,仅需要原子坐标即可,对应atomic类型。 不同atom_style对应的data文件格式不同,下面分别介绍这三种原子...
简单来说atom style定义了大类,atom type定义了大类中的小类。比如一个水分子中,所有粒子的atom_style都是full,但是在这个style下,又区分为氧原子type和氢原子type。一个模拟中可以由多个type,但是只能有一个style。atom_style定义好后就约束了data文件中具体内容。atom_style的语法是 atom_style <style> #举例:...
在lammps模拟中,不同的模拟体系对原子类型有一定的要求,最常用的原子类型是atomic、charge、full类型。 聚合物原子有键连接,对应full类型,如果采用反应势(reaxff),对应原子类型为charge类型,对于金属体系,相对比较简单,仅需要原子坐标即可,对应atomic类型。 不同atom_style对应的data文件格式不同,下面分别介绍这三种原子...
目前已经安装了molecule包，kspace包，rigid包，manybody包，但是无法使用atom_style full命令，运行一直存在...
atom_style是full类型。 我看lammps手册上atom-style只有sphere,dipole,ellipsoid,line,tri,peri,body。什么是full类型 jiezhou5322 3楼: Originally posted by 亚历山大11 at 2016-02-27 21:58:35 我看lammps手册上atom-style只有sphere,dipole,ellipsoid,line,tri,peri,body。什么是full类型... 红框里是full的解...
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atom_style full boundary p p p pair_style lj/cut/coul/long 14 pair_modify mix arithmetic tail yes kspace_style ewald 0.0001 bond_style harmonic angle_style harmonic # box, start molecules on simple cubic lattice lattice sc 3.2 region box block 0 10 0 10 0 10 ...
atom_style full timestep 1 neigh_modify every 1 delay 0 check yes #读取模型 read_data co2.data group CO2 type 1 2 #势函数类型设置 pair_style lj/cut/coul/cut 12.0 bond_style harmonic angle_style harmonic pair_modify mix geometric
核壳模型中,需要采用的atom_style为full。 这时,在输入的data文件中需要包含以下关键词(实际输入时需要删除尖括号) # notes: in<>is number, when input numerical values, please delete<><number of atoms>atoms<number of bonds>bonds<number of angles>angles<number of dihedrals>dihedrals<number of atom...
在LAMMPS中使用MEAM势进行三元素模拟时,需要进行以下步骤: 1.定义原子类型:首先,您需要在LAMMPS输入脚本中定义三种原子类型。例如,假设您的三种元素分别是A、B、C,可以使用`atom_style full`命令定义每个原子类型的属性。 2.导入MEAM势文件:您需要导入MEAM势文件以定义相互作用势能。MEAM势文件通常以`.alloy`或`.se...