atom_style atomic:在LAMMPS中,原子风格可以是“atomic”(原子)、“charge”(带电)或“molecular”(分子) boundary p p p:这定义了模拟盒子的边界条件。在这里,所有的三个方向(x, y, z)都被设置为周期性边界条件 neighbor 0.3 bin:LAMMPS中存在着截断半径,超出截断半径的相邻原子,不再考虑作用力0.3用于确定何时...
① atom_style命令用来定义模拟过程中原子的类型 ② 语法:atom_style style args style 为amoeba or angle or atomic or body or bond or charge or dipole or dpd or edpd or electron or ellipsoid or full or line or mdpd or molecular or oxdna or peri or smd or sph or sphere or or bpm/sphere...
3boundary p p p # 定义边界条件，p p p 表示在三个方向上都使用周期性边界条件 4atom_style atomic # 定义原子的类型及属性 5# 读取结构文件“structure.d”，里面包含仿真结构模型的具体信息 6read_data structure.d 7## 定义原子间的作用势函数 8pair_style tersoff #作用势类型，我们的仿真系统为Si, ...
atom_style atomic #原子类型(金属) Neighbor 0.3 bin #建近邻表参数(rc+0.3)bin表示为近邻表类型。 neigh_modify delay 5 #间隔多少载荷步重新形成近邻表L 2、ammps计算输入文件# create geometry创建初始几何构形Lattice hex 0.93#指定晶格类型(二维hex)和晶格常数Region box block 0 100 0 40 -0.25 0.25#...
3boundary p p p # 定义边界条件,p p p 表示在三个方向上都使用周期性边界条件 4atom_style atomic # 定义原子的类型及属性 5# 读取结构文件“structure.d”,里面包含仿真结构模型的具体信息 6read_data structure.d 7## 定义原子间的作用势函数 ...
本例主要详解使用lammps自带的region命令在圆柱形Ni纳米柱中插入一层石墨烯。用到的关键命令是region cylinder（1）#in文件基本参数设置（2）units metal（3）boundary p p p（4）atom_style atomic（5）（6）#沿着Z轴方向生成一个圆柱形的Ni纳米柱，圆柱旋转轴坐标（0,0）（7）#半径为30，圆柱上下...
本文介绍lammps不同原子类型(atom_style)对应的data文件格式,以及不同原子类型之间data的相互转换方法。 在lammps模拟中,不同的模拟体系对原子类型有一定的要求,最常用的原子类型是atomic、charge、full类型。 聚合物原子有键连接,对应full类型,如果采用反应势(reaxff),对应原子类型为charge类型,对于金属体系,相对比较简...
Atom-style: Atom-style 定义了模拟体系中的原子属性。 Delete-atoms: Pair-style: Pair-style 定义了相互作用力场类型,即势函数。 原子定义 1、 Read-data/read-restart: Read-data 或 read-restart 为从 data 或 restart 文件中读取内容来定义原子。
2units metal # 定义仿真过程中用到的单位系统 3boundary p p p # 定义边界条件,p p p 表示在三个方向上都使用周期性边界条件 4atom_style atomic # 定义原子的类型及属性 5# 读取结构文件“structure.d”,里面包含仿真结构模型的具体信息 6read_data structure.d 7## 定义原子间的作用势函数 8pair_style...
atom_style atomic lattice fcc 3.615 region box block 0 20 0 20 0 20 create_box 1 box create_atoms 1 box ``` 2. 定义模拟参数 接下来需要定义模拟所需的参数,包括弯曲速度、模拟时间等,示例代码如下: ``` p本人r_style eam/fs p本人r_coeff * * Cu_u3.eam variable str本人n equal 0.05 var...