先简单说一下HMMER安装过程吧。 从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度以及更高的搜索速度,但其应用远没有blast普及。 下载官网 http://hmmer.org/ 下载后tar -zxvf 解压, cd ./configure --prefix=/pu...
而且通过源码安装,可以同时方便的同时安装 HMMER 2 版本和 HMMER 3 版本,这样就可以使用一些 HMMER 3 不具有的,而 HMMER 2 具有的功能。源码安装具体步骤如下: 下载源码安装压缩包 首先,通过weget 命令行在eddylab.org/software/hmmer/hmmer-3.3.2.tar.gz路径获得,随后解压缩并通过cd命令进入解压后的 hmmer-3.3...
windows系统,直接下载二进制压缩包,解压就可以使用,下载地址: http://hmmer.janelia.org/static/binaries/hmmer3.0_windows.zip hmmer包含的程序 phmmer: 与Blastp类似,使用一个蛋白质序列搜索蛋白质序列库; > phmmer tutorial/HBB HUMAN uniprot sprot.fa jackhmmer: 与psiBlast类似,蛋白质序列迭代搜索蛋白质序列库...
在Ubuntu 24.04 LTS上安装HMMER(Hidden Markov Model ER),你可以按照以下步骤进行操作。HMMER是一款用于搜索和分析生物序列数据库中隐藏马尔可夫模型的工具,广泛应用于生物信息学领域。 1. 检查Ubuntu 24.04 LTS的系统要求和HMMER的兼容性 Ubuntu 24.04 LTS通常满足HMMER的基本系统要求,但最好检查HMMER的官方文档或发布说...
window上安装harbor windows安装hmmer软件 HMMer在Windows环境下的安装 遇到的困难 官网www.hmmer.org上没有Windows版的下载链接 下载链接404 解决 方案1 方案2 遇到的困难 刚刚入门生信,想要学着用HMMer工作。尽管在下在移动硬盘里装好了Ubuntu系统,但是日常用的系统还是Windows(移动硬盘带Ubuntu还是有点二的),因此想...
比如我是直接在下载目录（Download）解压的，所以我的命令如下：cd C:\Users\25332\Downloads\hmmer-3....
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expect安装和使用 2018-06-08 22:29 −Expect是一个我们常在shell交互时常用到的工具,它主要由expect-send组成。Expect是等待输出内容中的特定字符。然后由send发送特定的相应。Expect的工作流程类似于:小明和小红说:hello,小红发现小明说的是hello,然后就回复小明hi。然后小明说:你好... ...
下载HMMER3.0 for windows ，然后解压缩即可，通过命令行运行。我下载了HMMER3.0 for windows，解压缩...
3. 如果安装只支持Intel的软件,比如hmmer时候,就可以这样 ibrew install hmmer 4. 同时可以正常brew安装arc架构软件,比如calibre brew install calibre 真的很棒! 附上参考链接: stackoverflow.com/quest docs.brew.sh/FAQ# 发布于 2023-04-27 12:09・IP 属地浙江 ...