一、配置Java环境 1. 下载/拷贝文件:jdk-8u144-windows-i586_8.0.1440.1.exe; 2.双击文件进行安装,安装路径非空格、非中文路径,最好安装在C盘; 一.JDK的安装 首先进入Oracle的官网: http://www.oracle.com/index.html 点击箭头所示的链接后,便可以选择自己要下载的JDK的版本,我直接选择下载JSE 点击连... ...
此时使用windows快捷键,打开运行窗口,键盘摁下win+r,win键就是ctrl和alt旁边的那个不是fn的键,此时弹出运行窗口,在其中输入cmd,随后回车 如果显示上述情况,那么就安装成功了 使用hmmscan扫描蛋白序列集合 详细见另一篇推文….(亦即基因家族那篇) 常见使用报错 剩下的就没问题了…. 总结 windows下使用编译好的(...
官网www.hmmer.org上没有Windows版的下载链接 下载链接404 解决 方案1 方案2 遇到的困难 刚刚入门生信,想要学着用HMMer工作。尽管在下在移动硬盘里装好了Ubuntu系统,但是日常用的系统还是Windows(移动硬盘带Ubuntu还是有点二的),因此想在Windows下安装HMMer。然而: 官网www.hmmer.org上没有Windows版的下载链接 下载...
4.3.1 下载安装包后解压直接使用 首先去官网下载 Windows 版本的压缩包。由于目前官网的最新版本不支持 Windows 系统,所以官网并没有直接的下载链接,在这里,参考——HMMer在Windows环境下的安装_我就叫陌了这还能重名的博客-CSDN博客_hmmer安装(不得不感慨,这位网友真的太有才了!) ,通过访问http://eddylab.org/sof...
这样用起来比较麻烦,如果可以将 HMMER 加入 Windows环境变量(Path),则就可以在任意文件目录下调用任何...
最近几天需要集中安装软件,尤其是不需要conda安装的,存在依赖的软件,尽量的自己去配置环境变量,针对个别在安装时报错的软件,简单记录一下,等过段时间有了数据后,会再具体的写一些这些软件的具体使用方法,结果解读。先简单说一下HMMER安装过程吧。 从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的...
下载HMMER3.0 for windows ,然后解压缩即可,通过命令行运行。我下载了HMMER3.0 for windows,解压缩...
用惯了Windows之后再接触Linux操作系统首先印象就是繁杂的命令行和看似复杂的文件系统。本人作为Linux新手写作本博客只作为参考,如有不当,敬请指正! 话不多说,先上图: 上图便是Linux文件系统目录,下面我一一介绍其作用 注:下文所配图均为Linux Centos7发行版截图!!! /bin......
在conda环境中安装hmmer,你可以按照以下步骤进行操作: 打开命令行终端: 打开你的命令行终端,比如Terminal(macOS/Linux)或Anaconda Prompt(Windows)。 创建并激活conda环境(如果尚未创建): bash conda create -n myenv python=3.8 # 创建一个名为myenv的环境,并指定Python版本为3.8 conda activate myenv # 激活该...
2016-08-15 09:18 −详见:http://blog.shenwei.me/local-blast-installation/ Linux系统中NCBI BLAST+本地化教程 本文面向初学者(最好还是懂得基本的linux使用),高手可直接忽视。不介绍Windows系统中的安装方法,一是因为思路一样,二... 不知道怎么取名字 ...