http://hmmer.janelia.org/static/binaries/hmmer3.0_windows.zip hmmer包含的程序 phmmer: 与Blastp类似,使用一个蛋白质序列搜索蛋白质序列库; > phmmer tutorial/HBB HUMAN uniprot sprot.fa jackhmmer: 与psiBlast类似,蛋白质序列迭代搜索蛋白质序列库; > j
hmmer3.0我在http://hmmer.janelia.org/download.html#windows网站下了之后没有什么安装文件之类，也安...
HMMER是一个软件包,提供了一类被称为轮廓隐马尔可夫模型(此处中文名为直译,英文原称为 profile hidden Markov models, profile HMMs 或 profiles)的工具,这些工具用于制作蛋白质和DNA序列域家族概率模型,以及可以使用这些工具来注释新的序列。不同于 Blast 等工具,HMMER 使用的是集成算法(ensemble algorithms),而不是...
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windows系统安装HMMER 3.0,下载地址: http://hmmer.janelia.org/static/binaries/hmmer3.0_windows.zip 选中网址--右击--选择迅雷下载,即可下载,下载后解压即可(建议直接解压到分区盘,如D盘下,为方便使用可以把文件夹名称Hmmer 3.0直接改为Hmmer)。 添加环境变量 ...
hmmer从官网下载最新版:http://www.hmmer.org/ 通过filezilla上传到linux系统中。 用mv命令将其放置在固定位置,我一般是~/app gz文件用gunzip解压,tar文件用tar -xf 命令解压 cd hmmer-3.3.2 ./configure make make check 完成安装 接下来需要修改调用命令,使得在任何地方都能调用hmmer软件。 笔者... 查看原文...
MSYS的安装和使用 2010-03-23 15:26 −MSYS:Minimal GNU(POSIX)system on Windows,是一个小型的GNU环境,包括基本的bash,make等等。是Windows下最优秀的GNU环境。(是否厌倦了Cygwin蜗牛般的shell环境,试试MSYS中的rxvt吧) 另: MinGW:即Minimalist G... ...
Hmmer安装与使用 Hmmer的安装与使用 从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及。 hmmer下载与安装...