输入conda安装命令: 使用conda来安装hmmer。你可以从bioconda渠道安装hmmer,这样可以确保安装的是经过测试和验证的版本。 bash conda install -c bioconda hmmer 指定hmmer包名称及版本号(如果需要): 如果你需要安装特定版本的hmmer,可以在命令中指定版本号。例如,安装hmmer 3.4: bash conda install -c bioconda hmmer...
准备 conda 安装hmmer conda create-n protein python=2#创建环境conda activate protein#激活环境conda install-y hmmer hmmer-3.2.1|7.1MB|### | 100%Preparing transaction:done Verifying transaction:done Executing transaction:done##安装成功 准备数据 基因组文件:包括cds\pep\gff 拟南芥的某基因家族蛋白序列 ...
通过软件仓库安装 $ sudobrewinstallhmmer# OS/X, HomeBrew$ sudo portinstallhmmer# OS/X, MacPorts$ sudo aptinstallhmmer# Linux (Ubuntu, Debian...)$ sudo dnfinstallhmmer# Linux (Fedora)$ sudo yuminstallhmmer# Linux (older Fedora)$ sudo condainstall-cbiocorehmmer# Anaconda 通过源码编译安装 $wge...
基因功能预测工具-HMMER的安装 最近几天需要集中安装软件,尤其是不需要conda安装的,存在依赖的软件,尽量的自己去配置环境变量,针对个别在安装时报错的软件,简单记录一下,等过段时间有了数据后,会再具体的写一些这些软件的具体使用方法,结果解读。先简单说一下HMMER安装过程吧。 从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,...
conda activate python3 conda install -y -c bioconda/label/cf201901 transdecoder 下载速度比较慢,下好后,如果直接运行TransDecoder.Predict,会显示command not found。 在whereis transdecoder时,会提醒没有安装URI/Escape模块,使用Perl安装一下 ###启动 Perl CPAN ...
最近几天需要集中安装软件,尤其是不需要conda安装的,存在依赖的软件,尽量的自己去配置环境变量,针对个别在安装时报错的软件,简单记录一下,等过段时间有了数据后,会再具体的写一些这些软件的具体使用方法,结果解读。先简单说一下HMMER安装过程吧。 从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的...
最近几天需要集中安装软件,尤其是不需要conda安装的,存在依赖的软件,尽量的自己去配置环境变量,针对个别在安装时报错的软件,简单记录一下,等过段时间有了数据后,会再具体的写一些这些软件的具体使用方法,结果解读。先简单说一下HMMER安装过程吧。 从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的...
最近几天需要集中安装软件,尤其是不需要conda安装的,存在依赖的软件,尽量的自己去配置环境变量,针对个别在安装时报错的软件,简单记录一下,等过段时间有了数据后,会再具体的写一些这些软件的具体使用方法,结果解读。先简单说一下HMMER安装过程吧。 从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的...