output_folder ├── fastq ├── sam ├── pairs ├── hic │ └── binned └── plots └── stats 从名字可以看出,分别保存了fastq, sam, pairs信息, 多种分辨率的hic文件, 以及一些统计结果的可视化. 这个工具包含很多种hic数据的常规分析,例如A/B compartments, PCA分析, TADs and TAD boun...