外泌体研究、检测/分子互作、引物/基因合成、测序、蛋白抗体等7 人赞同了该文章 关于Hi-C Hi-C(High-through chromosome conformation capture)技术源于染色体构象捕获(Chromosome conformation capture, 3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间...
解析全基因组互作模式,如启动子和增强子互作 构建三维空间结构模型,如研究基因组三维结构特征:compartment,TAD,loop等 构建全基因组互作图谱 辅助提升基因组组装 构建基因组单体型图谱 二、原理及步骤 1、甲醛固定 先加入甲醛将基因组中参与染色质互作作用的蛋白质凝固。一般将活体样本在室温用 1-3%的甲醛处理 10-30m...
复达检测中心 Hi-C检测方法是一种全基因组范围内的染色质互作构象分析方法。它主要以高通量测序为手段,基于3C技术,通过一系列步骤来捕捉染色质的构象。简单来说,就是先制备适合Hi-C的3C模板,然后用限制酶切割并连接生物素标记的核苷酸,再进行DNA纯化剪切。之后,利用生物素pull-down保证只有连接的部分用于分析,最后将...
Hic技术是一种高通量成像染色质的技术,通过对染色质的交联、消化、连接和测序等步骤,可以获得染色质的空间结构和相互作用信息。Hic技术在染色质的三维组装、突变引起的基因组结构变化、跨物种染色质互作和染色质折叠与转录调控等方面有广泛的应用。虽然Hic技术具有优势和挑战,但其在染色质研究中发挥着重要的作用,为我们...
Hi-C是高通量染色体构象捕获(High-throughput Chromosome Conformation Capture, Hi-C)技术的简称,开发于2009年,最初用于捕获全基因组范围内所有的染色质内和染色质间的空间互作信息,目前已应用于基因表达的空间调控机制研究、构建染色体水平参考基因组、构建单体型图谱等。
HiC技术,全称为染色质构象捕获技术(Chromosome Conformation Capture, 3C),是一种革命性的生物信息学工具,它让我们能够在分子水平上观察和分析基因组的空间组织。通过捕捉DNA片段之间的物理接触,HiC技术为我们提供了一张基因组的“地图”,揭示了基因在三维空间中如...
先加入甲醛将基因组中参与染色质互作作用的蛋白质凝固。一般将活体样本在室温用 1-3%的甲醛处理 10-30min,但是此步骤会减少限制内切酶对DNA序列的消化效率,需要严格控制。 2、酶切序列 用限制性内切酶切割基因组,打断后的片段大小会影响测序分辨率,一般有两种酶可供选择:6bp 的限制性内切酶,4bp 的限制性内切酶。
Hi-C互作图谱 Hi-C结果中最常见的是染色质接触图谱,它的横轴和纵轴表示一定分辨率的基因组坐标。下图展示的是人类14号染色体内部互作的图谱。每个像素表示一个1Mb的位点与另一个1Mb的位点之间所有的相互作用,强度对应于读取的reads数。富集到越多的reads,颜色越红。