跟3C升级到Hi-C相类似,ChIA-PET可以看作ChIP-loop的提升版,从研究单环形成过程中的蛋白质作用转变为研究染色体3D结构形成中的蛋白质功能,从而为Hi-C提供重要的信息补充。 3C及其一系列衍生技术,特别是Hi-C,为染色质3D结构研究提供了强大的工具,从而可以更清晰地观察染...
Hi-C技术的基本原理是通过对细胞内的染色体进行特殊的化学修饰,使得相邻的染色体片段之间的特殊碱基对在经过特殊条件下可以连接在一起。然后,将修饰后的染色体分解成较小的片段,并使用高通量测序技术来测定这些片段在染色体中出现的频率。根据这些信息,研究人员可以推断出染色体中基因之间的相对位置关系,并建立染色体构象图...
Hi-C技术是染色体构象捕获(Chromosome conformation capture,简称为3C)的一种衍生技术,是指基于高通量进行染色体构象的捕获,它能够在全基因组范围内捕捉不同基因座位之间的高分辨率空间交互信息,研究三维空间中调控基因的DNA元件。与WGS、RNA-seq、ATAC-seq、 CUT&Tag等多组学联合分析,研究不同物种基因组空间结构(compar...
^^|SC1ENCEHi-C:高通量染色体构象分析技术郭晓强Hi-C 是一种分析染色伸空间构象的高通量测序技术•它有助于硏究者理解染色伸 三维空间结构 、 染色侔之间相互作用以及基因表达的空间调控机制.相关结果深化了对 组织友育和癌症发生等过程的认识而这种技术的诞生.缘起于科学家对染色伸及其结 构持续不断之探索染色体...
Hi-C技术是三维基因组学的主要研究方法,新的DLO Hi-C染色体构象捕获技术,采用同时酶切酶连的方式,将DNA接头连接在染色体内切酶切口末端上,然后进行邻近酶连,最后将用MmeI内切酶酶切消化,回收固定大小互作DNA片段,从而大大地降低了背景数据...
2002年,哈佛大学德克尔(J.Dekker)小组首先发明染色体构象捕获(chromosome conformation capture)技术[1],从而为解析染色体3D结构奠定了坚实基础,由于该技术3个英文单词的首字母均为C,故又称3C技术。 归纳起来,3C技术主要包括6步[2]。第一步,固定。使用固定剂(常为甲醛)将靠近染色体的2个区域相连,固定剂在这里发挥...
【Record 】Hi-C技术源于染色体构象捕获 (Chromosome conformation capture, 3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,通过对染色质内全部DNA相互作用模式进行捕获,获得高分辨率的染色质三维结构信息。2009年,Job Dekker研究团队首次...
基因组三维结构在DNA复制,DNA损伤修复,基因转录调控中扮演着重要的角色.Hi-C是目前研究基因组三维结构的主要手段之一,但是存在背景噪音大,试验成本高,试验流程繁琐,缺乏对随机连接噪音的评价等缺陷,因而限制了三维基因组学的发展.为此,我们开发了一种简单经济的染色体构象捕获技术,即DLO Hi-C(digestion-ligation-only ...
2.根据权利要求1所述DLO Hi-C染色体构象捕获方法,其特征在于:所述步骤1)中,甲醛水溶液的质量分数为1～3%,所述终止剂为甘氨酸,所述溶解所用的溶剂为1×的NEBuffer2.1,两管细胞的细胞数目均为3×106～8×106个。 3.根据权利要求1或2所述DLO Hi-C染色体构象捕获方法,其特征在于:所述步骤2)中,加入终浓度为...
三维Hi-c Call TAD高通量染色体构象捕获与转录组联合分析软件是由广州辉荣兰森生物科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2017SR087721,属于分类,想要查询更多关于三维Hi-c Call TAD高通量染色体构象捕获与转录组联合分析软件著作的著作权信息就到天眼查官网!